ਜਾਣਕਾਰੀ

5.5: ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਤੇ ਲਿਗੈਂਡਸ ਵਿਚਕਾਰ ਪੂਰਕ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ- ਇਮਿਊਨ ਸਿਸਟਮ ਅਤੇ ਇਮਯੂਨੋਗਲੋਬੂਲਿਨ - ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ

5.5: ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਤੇ ਲਿਗੈਂਡਸ ਵਿਚਕਾਰ ਪੂਰਕ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ- ਇਮਿਊਨ ਸਿਸਟਮ ਅਤੇ ਇਮਯੂਨੋਗਲੋਬੂਲਿਨ - ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

5.5: ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਤੇ ਲਿਗੈਂਡਸ ਵਿਚਕਾਰ ਪੂਰਕ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ- ਇਮਿਊਨ ਸਿਸਟਮ ਅਤੇ ਇਮਯੂਨੋਗਲੋਬੂਲਿਨ

ਟਾਰਗੇਟਡ ਗਲਾਈਕਨ ਡਿਗਰੇਡੇਸ਼ਨ ਵੀਵੋ ਵਿੱਚ ਕੈਂਸਰ ਵਿਰੋਧੀ ਪ੍ਰਤੀਰੋਧੀ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆ ਨੂੰ ਸੰਭਾਵਿਤ ਕਰਦਾ ਹੈ

ਵਰਤਮਾਨ ਵਿੱਚ PD-1 ਅਤੇ CTLA-4 ਰੀਸੈਪਟਰ ਮਾਰਗਾਂ ਨੂੰ ਨਿਸ਼ਾਨਾ ਬਣਾਉਣ ਵਾਲੇ ਇਮਿਊਨ ਚੈਕਪੁਆਇੰਟ ਇਨਿਹਿਬਟਰ ਥੈਰੇਪੀਆਂ ਕੁਝ ਖਾਸ ਕੈਂਸਰਾਂ ਲਈ ਸ਼ਕਤੀਸ਼ਾਲੀ ਇਲਾਜ ਵਿਕਲਪ ਹਨ ਹਾਲਾਂਕਿ, ਕੈਂਸਰ ਦੀਆਂ ਕਿਸਮਾਂ ਦੇ ਜ਼ਿਆਦਾਤਰ ਮਰੀਜ਼ ਅਜੇ ਵੀ ਜਵਾਬ ਦੇਣ ਵਿੱਚ ਅਸਫਲ ਰਹਿੰਦੇ ਹਨ। ਸਿੱਟੇ ਵਜੋਂ, ਇਮਿਊਨ ਦਮਨ ਵਿੱਚ ਵਿਚੋਲਗੀ ਕਰਨ ਵਾਲੇ ਵਿਕਲਪਕ ਮਾਰਗਾਂ ਨੂੰ ਖੋਜਣ ਅਤੇ ਰੋਕਣ ਵਿੱਚ ਦਿਲਚਸਪੀ ਹੈ। ਅਜਿਹੀ ਇੱਕ ਵਿਧੀ ਹੈ ਖ਼ਤਰਨਾਕਤਾ ਵਿੱਚ ਸਿਓਲੋਗਲਾਈਕਨਸ ਦਾ ਇੱਕ ਅਪਰੇਗੂਲੇਸ਼ਨ, ਜੋ ਕਿ ਹਾਲ ਹੀ ਵਿੱਚ ਕਈ ਵਿਧੀਆਂ ਦੁਆਰਾ ਇਮਿਊਨ ਸੈੱਲ ਐਕਟੀਵੇਸ਼ਨ ਨੂੰ ਰੋਕਣ ਲਈ ਦਿਖਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ ਅਤੇ ਇਸਲਈ ਇੱਕ ਨਿਸ਼ਾਨਾਯੋਗ ਗਲਾਈਕੋਇਮਿਊਨ ਚੈਕਪੁਆਇੰਟ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ। ਕਿਉਂਕਿ ਇਹ ਗਲਾਈਕੈਨ ਕੈਨੋਨੀਕਲ ਤੌਰ 'ਤੇ ਨਸ਼ੀਲੇ ਪਦਾਰਥਾਂ ਦੇ ਯੋਗ ਨਹੀਂ ਹਨ, ਅਸੀਂ ਇੱਕ αHER2 ਐਂਟੀਬਾਡੀ-ਸਿਆਲੀਡੇਸ ਕਨਜੁਗੇਟ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਹੈ ਜੋ ਛਾਤੀ ਦੇ ਕੈਂਸਰ ਸੈੱਲਾਂ ਤੋਂ ਸੰਭਾਵੀ ਅਤੇ ਚੋਣਵੇਂ ਰੂਪ ਵਿੱਚ ਵਿਭਿੰਨ ਸਿਓਲੋਗਲਾਈਕਨਾਂ ਨੂੰ ਕੱਢ ਦਿੰਦਾ ਹੈ। ਸਿੰਜੇਨਿਕ ਛਾਤੀ ਦੇ ਕੈਂਸਰ ਦੇ ਮਾਡਲਾਂ ਵਿੱਚ, ਡੀਸੀਲੀਲੇਸ਼ਨ ਨੇ ਇਮਿਊਨ ਸੈੱਲ ਘੁਸਪੈਠ ਅਤੇ ਕਿਰਿਆਸ਼ੀਲਤਾ ਨੂੰ ਵਧਾਇਆ ਅਤੇ ਚੂਹਿਆਂ ਦੇ ਬਚਾਅ ਨੂੰ ਲੰਮਾ ਕੀਤਾ, ਇੱਕ ਪ੍ਰਭਾਵ ਜੋ ਟਿਊਮਰ-ਘੁਸਪੈਠ ਕਰਨ ਵਾਲੇ ਮਾਈਲੋਇਡ ਸੈੱਲਾਂ 'ਤੇ ਪਾਏ ਗਏ ਸਿਗਲੇਕ-ਈ ਚੈਕਪੁਆਇੰਟ ਰੀਸੈਪਟਰ ਦੇ ਪ੍ਰਗਟਾਵੇ 'ਤੇ ਨਿਰਭਰ ਕਰਦਾ ਸੀ। ਇਸ ਤਰ੍ਹਾਂ, ਐਂਟੀਬਾਡੀ-ਸਿਆਲੀਡੇਸ ਕਨਜੁਗੇਟਸ ਗਲਾਈਕੋਇਮਿਊਨ ਚੈਕਪੁਆਇੰਟ ਥੈਰੇਪੀ ਲਈ ਇੱਕ ਸ਼ਾਨਦਾਰ ਢੰਗ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੇ ਹਨ।


ਪਿਛੋਕੜ

ਮੇਜ਼ਬਾਨ ਰੱਖਿਆ [1, 2] ਵਿੱਚ ਜਿਗਰ ਦੀ ਕੇਂਦਰੀ ਭੂਮਿਕਾ ਹੁੰਦੀ ਹੈ। ਇਸ ਦਾ ਵਿਆਪਕ ਕੇਸ਼ਿਕਾ ਨੈਟਵਰਕ, ਸਾਈਨਸੌਇਡਜ਼, ਸਰੀਰ ਦੀ ਸਭ ਤੋਂ ਪ੍ਰਭਾਵਸ਼ਾਲੀ ਸਕੈਵੇਂਜਰ ਸੈੱਲ ਪ੍ਰਣਾਲੀ ਰੱਖਦਾ ਹੈ ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਕੁੱਪਫਰ ਸੈੱਲ (ਕੇਸੀ, ਨਿਵਾਸੀ ਮੈਕਰੋਫੈਜ ਦਾ ਸਰੀਰ ਦਾ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਡਾ ਭੰਡਾਰ [3]), ਅਤੇ ਜਿਗਰ ਦੇ ਸਾਈਨਸੌਇਡਲ ਐਂਡੋਥੈਲਿਅਲ ਸੈੱਲ (LSECs) ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ਦਹਾਕਿਆਂ ਤੋਂ ਕੇ.ਸੀ., ਸਾਈਨਸਾਇਡਲ ਲੂਮੇਨ ਦਾ ਸਾਹਮਣਾ ਕਰ ਰਹੇ ਹਨ, ਇਹ ਵਿਸ਼ਵਾਸ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਸੀ ਕਿ ਖੂਨ ਤੋਂ ਪੈਦਾ ਹੋਣ ਵਾਲੀ ਸਮੱਗਰੀ [4, 5] ਦੀ ਕਲੀਅਰੈਂਸ ਲਈ ਜ਼ਿੰਮੇਵਾਰ ਸਿਰਫ ਜਿਗਰ ਸੈੱਲ ਹਨ। ਇਸ ਦ੍ਰਿਸ਼ਟੀਕੋਣ ਨੂੰ 1980 ਅਤੇ 1990 ਦੇ ਦਹਾਕੇ ਦੌਰਾਨ ਅਧਿਐਨਾਂ ਦੀ ਇੱਕ ਲੜੀ ਦੁਆਰਾ ਚੁਣੌਤੀ ਦਿੱਤੀ ਗਈ ਸੀ ਜੋ ਇਹ ਦਰਸਾਉਂਦੀ ਹੈ ਕਿ LSECs ਦੁਆਰਾ ਮੁੱਖ ਤੌਰ 'ਤੇ ਬਹੁਤ ਸਾਰੇ ਸਰੀਰਕ ਮੈਕ੍ਰੋਮੋਲੀਕਿਊਲਸ ਅਤੇ ਕੋਲਾਇਡਜ਼ ਨੂੰ ਸਾਫ਼ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ, ਪਰ ਕੇਸੀ ਦੁਆਰਾ ਮਾਮੂਲੀ ਹੱਦ ਤੱਕ [6,7,8,9,10,11, 12,13,14,15]। ਅੱਜ ਇਹ ਸਵੀਕਾਰ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ ਕਿ LSECs ਅਤੇ KCs ਮਿਲ ਕੇ ਹੈਪੇਟਿਕ "ਕੂੜੇ ਦੀ ਨਿਕਾਸੀ ਦੇ ਦੋਹਰੇ ਸੈੱਲ ਸਿਧਾਂਤ" ਬਣਾਉਂਦੇ ਹਨ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ LSECs ਨੈਨੋਪਾਰਟਿਕਲਜ਼ (< 200 nm), ਕੋਲਾਇਡਜ਼, ਅਤੇ ਮੈਕਰੋਮੋਲੀਕਿਊਲਸ, ਅਤੇ KCs ਦੇ ਪ੍ਰਭਾਵੀ ਕਲੈਥਰਿਨ-ਮੀਡੀਏਟਿਡ ਐਂਡੋਸਾਈਟੋਸਿਸ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤੇ ਜਾਂਦੇ ਹਨ। ਸਮੱਗਰੀ [5]. ਖੋਜ ਜੋ ਕਿ ਇਹ ਸੈੱਲ ਖੂਨ ਦੀ ਨਿਕਾਸੀ ਦੇ ਕੰਮ ਨੂੰ ਇਸ ਤਰੀਕੇ ਨਾਲ ਸਾਂਝਾ ਕਰਦੇ ਹਨ, ਨੇ ਸੁਝਾਅ ਦਿੱਤਾ ਕਿ LSECs ਇੱਕ ਉੱਚ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਐਂਡੋਥੈਲਿਅਮ ਹਨ ਜੋ KCs ਦੇ ਸਮਾਨ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਵਾਲੇ ਹਨ, ਨਾ ਸਿਰਫ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਤੌਰ 'ਤੇ, ਪਰ ਅਣੂ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਵੀ। ਮੌਜੂਦਾ ਅਧਿਐਨ ਦੋ ਸੈੱਲਾਂ ਦੀਆਂ ਸਮਾਨਤਾਵਾਂ ਅਤੇ ਅੰਤਰਾਂ ਦਾ ਅਧਿਐਨ ਕਰਨ ਲਈ, ਉਹਨਾਂ ਦੇ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ ਅਤੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੀ ਤੁਲਨਾ ਕਰਕੇ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ।

ਜਿਗਰ ਲਗਭਗ 25% ਕਾਰਡੀਅਕ ਆਉਟਪੁੱਟ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਸਾਈਨਸੌਇਡਲ ਸੈੱਲਾਂ ਨੂੰ ਖੂਨ ਦੀ ਵੱਡੀ ਮਾਤਰਾ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਇਸ ਤਰ੍ਹਾਂ ਇਹਨਾਂ ਸੈੱਲਾਂ ਨੂੰ ਖੂਨ ਦੀ ਸਮੱਗਰੀ ਦੀ ਨਿਗਰਾਨੀ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਵਿਲੱਖਣ ਸਥਿਤੀ ਵਿੱਚ ਰੱਖਦਾ ਹੈ। ਲਗਭਗ 80% ਅੰਗਾਂ ਦੀ ਖੂਨ ਦੀ ਸਪਲਾਈ ਅੰਤੜੀਆਂ ਨੂੰ ਨਿਕਾਸ ਕਰਦੀ ਹੈ ਅਤੇ ਇਸ ਵਿੱਚ (ਪੋਸ਼ਟਿਕ ਤੱਤਾਂ ਤੋਂ ਇਲਾਵਾ) ਜ਼ਹਿਰੀਲੇ, ਬੈਕਟੀਰੀਆ ਦੇ ਹਿੱਸੇ, ਵਾਇਰਸ, ਅਤੇ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਰਹਿੰਦ-ਖੂੰਹਦ ਉਤਪਾਦ ਸ਼ਾਮਲ ਹੁੰਦੇ ਹਨ ਜੋ LSECs ਅਤੇ KCs [5, 15] ਵਿੱਚ ਗ੍ਰਹਿਣ ਕਰਕੇ ਖੂਨ ਵਿੱਚੋਂ ਕੁਸ਼ਲਤਾ ਨਾਲ ਹਟਾਏ ਜਾਂਦੇ ਹਨ, ਇਸ ਤਰ੍ਹਾਂ ਰੋਕਦੇ ਹਨ। ਹੋਰ ਕਿਤੇ ਅਜਿਹੇ ਭਾਗਾਂ ਦੇ ਜਮ੍ਹਾ ਅਤੇ ਨੁਕਸਾਨਦੇਹ ਪ੍ਰਭਾਵ। LSECs ਵਾਇਰਸ [10, 11, 15,16,17,18,19,20,21,22,23] ਸਮੇਤ ਘੁਲਣਸ਼ੀਲ ਮੈਕਰੋਮੋਲੀਕਿਊਲਸ ਅਤੇ ਨੈਨੋ ਕਣਾਂ ਦੇ ਗ੍ਰਹਿਣ ਲਈ ਇੱਕ ਅਸਧਾਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਉੱਚ ਸਮਰੱਥਾ ਦਿਖਾਉਂਦੇ ਹਨ। ਇਸ ਮੰਤਵ ਲਈ, LSECs ਕਈ ਉੱਚ ਐਫੀਨਿਟੀ ਐਂਡੋਸਾਈਟੋਸਿਸ ਰੀਸੈਪਟਰਾਂ ਨੂੰ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰਦੇ ਹਨ, ਜਿਨ੍ਹਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਕੁਝ ਪੈਟਰਨ ਮਾਨਤਾ ਸੰਵੇਦਕ ਹਨ। ਇਹਨਾਂ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ ਸਕੈਵੇਂਜਰ ਰੀਸੈਪਟਰ (SRs) ਸਟੈਬੀਲਿਨ-1 ਅਤੇ ਸਟੈਬੀਲਿਨ-2 [24, 25], ਮੈਕਰੋਫੇਜ ਮੈਨਨੋਜ਼ ਰੀਸੈਪਟਰ (CD206) [17], ਅਤੇ ਐਂਡੋਸਾਈਟਿਕ ਐਫਸੀ-ਗਾਮਾ ਰੀਸੈਪਟਰ IIb2 (FcγRIIb2, CD32b) [26]। ਇਸ ਤੋਂ ਇਲਾਵਾ, LSECs ਕਈ ਟੋਲ-ਵਰਗੇ ਰੀਸੈਪਟਰਾਂ (TLRs) [27,28,29] [27,28,29] ਨੂੰ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰਦੇ ਹਨ, ਅਤੇ ਚੂਹਿਆਂ ਵਿੱਚ, ਸੈੱਲਾਂ ਨੂੰ ਅਡੈਪਟਿਵ ਇਮਿਊਨ ਫੰਕਸ਼ਨਾਂ ਦੇ ਕੋਲ ਹੋਣ ਦੀ ਰਿਪੋਰਟ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਐਨੋਸਾਈਟੋਜ਼ਡ ਐਂਟੀਜੇਨਜ਼ ਨੂੰ ਭੋਲੇ CD8 + ਟੀ-ਸੈੱਲਾਂ ਵਿੱਚ ਯੋਗਦਾਨ ਪਾਉਣਾ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ। ਜਿਗਰ ਪ੍ਰਤੀਰੋਧਕ ਸਹਿਣਸ਼ੀਲਤਾ [1, 27, 30,31,32] ਲਈ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਮੈਮੋਰੀ ਟੀ-ਸੈੱਲਾਂ ਦੀ ਪੀੜ੍ਹੀ ਲਈ. KCs ਦੇ ਉਲਟ, LSECs ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ਫੈਗੋਸਾਈਟਿਕ ਨਹੀਂ ਹੁੰਦੇ ਪਰ ਜੇ KCs [33] ਖਤਮ ਹੋ ਜਾਂਦੇ ਹਨ ਤਾਂ ਇਹ 1 μm ਕਣ ਲੈ ਸਕਦੇ ਹਨ।

LSECs ਅਤੇ KCs ਦੇ ਸਕੈਵੈਂਜਰ ਸੈੱਲਾਂ [1, 2, 5] ਦੇ ਰੂਪ ਵਿੱਚ ਓਵਰਲੈਪਿੰਗ ਫੰਕਸ਼ਨਾਂ ਦੇ ਕਾਰਨ, ਵੱਖ-ਵੱਖ ਨਾੜੀਆਂ ਦੇ ਬਿਸਤਰੇ [34, 35] ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਵੱਡੇ ਐਂਡੋਥੈਲਿਅਲ ਸੈੱਲ ਵਿਭਿੰਨਤਾ, ਅਤੇ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਖੋਜ ਸਮੂਹਾਂ ਵਿਚਕਾਰ LSEC ਅਲੱਗ-ਥਲੱਗ ਅਤੇ ਪਛਾਣ ਲਈ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਤਰੀਕਿਆਂ ਦੀ ਘਾਟ. [36, 37], LSECs ਨੂੰ ਵਿਵਾਦਗ੍ਰਸਤ ਅਤੇ ਉਲਝਣ ਵਾਲੀ ਪਛਾਣ [37] ਦੇ ਇੱਕ ਸੈੱਲ ਵਜੋਂ ਦਰਸਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ। ਉਦਾਹਰਨ ਲਈ, ਪੈਨ-ਲਿਊਕੋਸਾਈਟ ਮਾਰਕਰ CD45 ਨੂੰ ਅਕਸਰ ਇਮਿਊਨ ਅਧਾਰਤ ਤਰੀਕਿਆਂ ਦੁਆਰਾ ਮਾਊਸ ਅਤੇ ਮਨੁੱਖੀ LSECs ਦੇ ਅਲੱਗ-ਥਲੱਗ ਲਈ ਇੱਕ ਨਕਾਰਾਤਮਕ ਚੋਣ ਮਾਪਦੰਡ ਵਜੋਂ ਵਰਤਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ ਪਰ ਚੂਹਾ LSECs [36, 38] ਵਿੱਚ ਦਰਸਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ। ਇਸ ਤੋਂ ਇਲਾਵਾ, LSECs ਸੱਭਿਆਚਾਰ [39, 40] ਵਿੱਚ ਤੇਜ਼ੀ ਨਾਲ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਬਣਾਉਂਦੇ ਹਨ, ਜੋ ਲੰਬੇ ਸਮੇਂ ਦੇ ਸਹਿ-ਸਭਿਆਚਾਰਾਂ ਲਈ ਇੱਕ ਸਮੱਸਿਆ ਪੈਦਾ ਕਰਦਾ ਹੈ ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਇਮਿਊਨ ਅਸੈਸ ਵਿੱਚ ਲਿਮਫੋਸਾਈਟਸ। ਇਹ ਸੈੱਲ ਫੰਕਸ਼ਨਾਂ ਅਤੇ ਅਣੂ ਸਮੀਕਰਨ ਪੈਟਰਨਾਂ ਦੀ ਪੜਚੋਲ ਕਰਦੇ ਸਮੇਂ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਪ੍ਰਾਇਮਰੀ ਸੈੱਲਾਂ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਦੇ ਮਹੱਤਵ ਨੂੰ ਉਜਾਗਰ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਅਤੇ ਬਾਇਓਮੈਡੀਕਲ ਖੋਜ ਵਿੱਚ ਵਰਤੀਆਂ ਜਾਂਦੀਆਂ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਕਿਸਮਾਂ ਵਿੱਚ LSEC ਅਤੇ KC ਜੀਨ ਅਤੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦੀ ਮੈਪਿੰਗ ਕਰਦਾ ਹੈ।

LSEC ਅਤੇ KC ਮਾਰਕਰਾਂ ਅਤੇ ਅਣੂ ਫੀਨੋਟਾਈਪਾਂ ਦੇ ਸੰਬੰਧ ਵਿੱਚ ਸਾਹਿਤ ਵਿੱਚ ਕੁਝ ਅੰਤਰ ਨੂੰ ਹੱਲ ਕਰਨ ਲਈ, ਅਸੀਂ ਤਾਜ਼ੇ ਅਲੱਗ-ਥਲੱਗ ਚੂਹੇ LSECs ਅਤੇ KCs ਦੇ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ ਅਤੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੀ ਸਿੱਧੀ ਤੁਲਨਾ ਕੀਤੀ। LSECs ਅਤੇ KCs ਦੇ ਜੀਨ/ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦੀ ਤੁਲਨਾ ਕਰਨ ਵਾਲੇ ਅਧਿਐਨ ਬਹੁਤ ਘੱਟ ਹਨ। ਸਾਡੇ ਗਿਆਨ ਦੇ ਸਭ ਤੋਂ ਉੱਤਮ ਲਈ, C57Bl/6 ਚੂਹਿਆਂ ਵਿੱਚ ਕੀਤੇ ਗਏ ਦੋਵੇਂ ਅਧਿਐਨਾਂ ਨੇ ਜਿਗਰ ਦੇ ਨਿਵਾਸੀ ਸੈੱਲ ਆਬਾਦੀ [41, 42] ਦੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਦੀ ਤੁਲਨਾ ਕੀਤੀ ਹੈ, ਪਰ LSEC ਸਕੈਵੇਂਜਰ ਜਾਂ ਇਮਿਊਨ ਫੰਕਸ਼ਨਾਂ ਦੀ ਚਰਚਾ ਕੀਤੇ ਬਿਨਾਂ। ਸਾਡਾ ਅਧਿਐਨ ਪਹਿਲੀ ਵਿਆਪਕ ਮਲਟੀਓਮਿਕਸ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਿੰਗ ਅਤੇ ਚੂਹੇ KCs ਅਤੇ LSECs ਦੀ ਤੁਲਨਾ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ। ਸਾਡੀਆਂ ਖੋਜਾਂ ਦੇ ਆਧਾਰ 'ਤੇ ਅਸੀਂ ਇਹ ਸਿੱਟਾ ਕੱਢਦੇ ਹਾਂ ਕਿ LSECs ਉਹਨਾਂ ਦੀਆਂ ਵੱਖਰੀਆਂ ਇਮਯੂਨੋਲੋਜੀਕਲ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਦੇ ਕਾਰਨ ਐਂਡੋਥੈਲੀਅਲ ਸੈੱਲਾਂ ਦੀਆਂ ਹੋਰ ਕਿਸਮਾਂ ਤੋਂ ਵੱਖਰੇ ਹਨ।


ਪਹੁੰਚ ਵਿਕਲਪ

1 ਸਾਲ ਲਈ ਪੂਰੀ ਜਰਨਲ ਪਹੁੰਚ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰੋ

ਸਾਰੀਆਂ ਕੀਮਤਾਂ NET ਕੀਮਤਾਂ ਹਨ।
ਵੈਟ ਚੈੱਕਆਉਟ ਵਿੱਚ ਬਾਅਦ ਵਿੱਚ ਜੋੜਿਆ ਜਾਵੇਗਾ।
ਚੈੱਕਆਉਟ ਦੌਰਾਨ ਟੈਕਸ ਗਣਨਾ ਨੂੰ ਅੰਤਿਮ ਰੂਪ ਦਿੱਤਾ ਜਾਵੇਗਾ।

ReadCube 'ਤੇ ਸਮਾਂ ਸੀਮਤ ਜਾਂ ਪੂਰੇ ਲੇਖ ਦੀ ਪਹੁੰਚ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰੋ।

ਸਾਰੀਆਂ ਕੀਮਤਾਂ NET ਕੀਮਤਾਂ ਹਨ।


ਅਨੁਕੂਲ ਸੈੱਲ

ਬੀ ਸੈੱਲ ਦੇ ਦੋ ਮੁੱਖ ਕਾਰਜ ਹਨ: ਉਹ ਟੀ ਸੈੱਲਾਂ ਨੂੰ ਐਂਟੀਜੇਨ ਪੇਸ਼ ਕਰਦੇ ਹਨ, ਅਤੇ ਸਭ ਤੋਂ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ, ਉਹ ਛੂਤ ਵਾਲੇ ਰੋਗਾਣੂਆਂ ਨੂੰ ਬੇਅਸਰ ਕਰਨ ਲਈ ਐਂਟੀਬਾਡੀਜ਼ ਪੈਦਾ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਐਂਟੀਬਾਡੀਜ਼ ਇੱਕ ਜਰਾਸੀਮ ਦੀ ਸਤਹ ਨੂੰ ਕੋਟ ਕਰਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਤਿੰਨ ਮੁੱਖ ਭੂਮਿਕਾਵਾਂ ਨਿਭਾਉਂਦੇ ਹਨ: ਨਿਰਪੱਖਕਰਨ, ਓਪਸੋਨਾਈਜ਼ੇਸ਼ਨ, ਅਤੇ ਪੂਰਕ ਸਰਗਰਮੀ।

ਨਿਰਪੱਖਤਾ ਉਦੋਂ ਵਾਪਰਦੀ ਹੈ ਜਦੋਂ ਰੋਗਾਣੂ, ਕਿਉਂਕਿ ਇਹ ਐਂਟੀਬਾਡੀਜ਼ ਵਿੱਚ ਢੱਕਿਆ ਹੁੰਦਾ ਹੈ, ਮੇਜ਼ਬਾਨ ਸੈੱਲਾਂ ਨੂੰ ਬੰਨ੍ਹਣ ਅਤੇ ਸੰਕਰਮਿਤ ਕਰਨ ਵਿੱਚ ਅਸਮਰੱਥ ਹੁੰਦਾ ਹੈ। ਓਪਸੋਨਾਈਜ਼ੇਸ਼ਨ ਵਿੱਚ, ਇੱਕ ਐਂਟੀਬਾਡੀ-ਬਾਉਂਡ ਜਰਾਸੀਮ ਨਿਊਟ੍ਰੋਫਿਲਜ਼ ਅਤੇ ਮੈਕਰੋਫੈਜਾਂ ਵਰਗੇ ਇਮਿਊਨ ਸੈੱਲਾਂ ਨੂੰ ਸੁਚੇਤ ਕਰਨ ਲਈ, ਜਰਾਸੀਮ ਨੂੰ ਘੇਰਨ ਅਤੇ ਹਜ਼ਮ ਕਰਨ ਲਈ ਲਾਲ ਝੰਡੇ ਵਜੋਂ ਕੰਮ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਪੂਰਕ ਬੈਕਟੀਰੀਆ ਨੂੰ ਸਿੱਧੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਨਸ਼ਟ ਕਰਨ, ਜਾਂ ਲਿਸਿੰਗ ਕਰਨ ਦੀ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ ਹੈ।

ਸੰਚਾਰ ਭਾਗ ਵਿੱਚ ਪੂਰਕ ਬਾਰੇ ਹੋਰ ਪੜ੍ਹੋ।

ਐਂਟੀਬਾਡੀਜ਼ ਦੋ ਤਰੀਕਿਆਂ ਨਾਲ ਪ੍ਰਗਟ ਕੀਤੇ ਜਾਂਦੇ ਹਨ। ਬੀ ਸੈੱਲ ਰੀਸੈਪਟਰ (ਬੀਸੀਆਰ), ਜੋ ਕਿ ਬੀ ਸੈੱਲ ਦੀ ਸਤ੍ਹਾ 'ਤੇ ਬੈਠਦਾ ਹੈ, ਅਸਲ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਐਂਟੀਬਾਡੀ ਹੈ। ਬੀ ਸੈੱਲ ਰੋਗਾਣੂਆਂ ਨੂੰ ਫੈਲਾਉਣ ਅਤੇ ਜੋੜਨ ਲਈ ਐਂਟੀਬਾਡੀਜ਼ ਵੀ ਛੁਪਾਉਂਦੇ ਹਨ। ਇਹ ਦੋਹਰਾ ਸਮੀਕਰਨ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹੈ ਕਿਉਂਕਿ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਸਮੱਸਿਆ, ਉਦਾਹਰਨ ਲਈ, ਇੱਕ ਬੈਕਟੀਰੀਆ, ਇੱਕ ਵਿਲੱਖਣ BCR ਦੁਆਰਾ ਪਛਾਣਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ ਅਤੇ B ਸੈੱਲ ਨੂੰ ਸਰਗਰਮ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਕਿਰਿਆਸ਼ੀਲ ਬੀ ਸੈੱਲ ਐਂਟੀਬਾਡੀਜ਼, ਜ਼ਰੂਰੀ ਤੌਰ 'ਤੇ ਬੀਸੀਆਰ, ਪਰ ਘੁਲਣਸ਼ੀਲ ਰੂਪ ਵਿੱਚ ਗੁਪਤ ਕਰਕੇ ਜਵਾਬ ਦਿੰਦਾ ਹੈ। ਇਹ ਸੁਨਿਸ਼ਚਿਤ ਕਰਦਾ ਹੈ ਕਿ ਜਵਾਬ ਬੈਕਟੀਰੀਆ ਦੇ ਵਿਰੁੱਧ ਖਾਸ ਹੈ ਜਿਸਨੇ ਸਾਰੀ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ ਸ਼ੁਰੂ ਕੀਤੀ ਹੈ।

ਹਰ ਐਂਟੀਬਾਡੀ ਵਿਲੱਖਣ ਹੁੰਦੀ ਹੈ, ਪਰ ਉਹ ਆਮ ਸ਼੍ਰੇਣੀਆਂ ਦੇ ਅਧੀਨ ਆਉਂਦੇ ਹਨ: IgM, IgD, IgG, IgA, ਅਤੇ IgE। (Ig ਇਮਯੂਨੋਗਲੋਬੂਲਿਨ ਲਈ ਛੋਟਾ ਹੈ, ਜੋ ਕਿ ਐਂਟੀਬਾਡੀ ਲਈ ਇੱਕ ਹੋਰ ਸ਼ਬਦ ਹੈ।) ਜਦੋਂ ਕਿ ਉਹਨਾਂ ਕੋਲ ਓਵਰਲੈਪਿੰਗ ਰੋਲ ਹੁੰਦੇ ਹਨ, IgM ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪੂਰਕ ਐਕਟੀਵੇਸ਼ਨ ਲਈ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹੁੰਦਾ ਹੈ IgD ਬੇਸੋਫਿਲਸ ਨੂੰ ਸਰਗਰਮ ਕਰਨ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਹੁੰਦਾ ਹੈ IgG ਨਿਰਪੱਖਕਰਨ, ਓਪਸਨਾਈਜ਼ੇਸ਼ਨ, ਅਤੇ ਪੂਰਕ ਐਕਟੀਵੇਸ਼ਨ ਲਈ IgA ਜ਼ਰੂਰੀ ਹੈ ਨਿਰਪੱਖਕਰਨ ਲਈ ਜ਼ਰੂਰੀ ਹੈ। ਗੈਸਟਰੋਇੰਟੇਸਟਾਈਨਲ ਟ੍ਰੈਕਟ ਅਤੇ IgE ਵਿੱਚ ਪਰਜੀਵੀ ਅਤੇ ਐਲਰਜੀ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਵਿੱਚ ਮਾਸਟ ਸੈੱਲਾਂ ਨੂੰ ਸਰਗਰਮ ਕਰਨ ਲਈ ਜ਼ਰੂਰੀ ਹੈ।

ਟੀ ਸੈੱਲ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਭੂਮਿਕਾਵਾਂ ਹੁੰਦੀਆਂ ਹਨ ਅਤੇ ਸਬਸੈੱਟਾਂ ਦੁਆਰਾ ਸ਼੍ਰੇਣੀਬੱਧ ਕੀਤੀਆਂ ਜਾਂਦੀਆਂ ਹਨ। ਟੀ ਸੈੱਲਾਂ ਨੂੰ ਦੋ ਵਿਆਪਕ ਸ਼੍ਰੇਣੀਆਂ ਵਿੱਚ ਵੰਡਿਆ ਗਿਆ ਹੈ: CD8+ ਟੀ ਸੈੱਲ ਜਾਂ CD4+ ਟੀ ਸੈੱਲ, ਜਿਸ ਦੇ ਆਧਾਰ 'ਤੇ ਸੈੱਲ ਦੀ ਸਤ੍ਹਾ 'ਤੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੌਜੂਦ ਹੁੰਦਾ ਹੈ। ਟੀ ਸੈੱਲ ਸੰਕਰਮਿਤ ਸੈੱਲਾਂ ਨੂੰ ਮਾਰਨ ਅਤੇ ਹੋਰ ਇਮਿਊਨ ਸੈੱਲਾਂ ਨੂੰ ਸਰਗਰਮ ਜਾਂ ਭਰਤੀ ਕਰਨ ਸਮੇਤ ਕਈ ਕਾਰਜ ਕਰਦੇ ਹਨ।

CD8+ T ਸੈੱਲਾਂ ਨੂੰ ਸਾਇਟੋਟੌਕਸਿਕ ਟੀ ਸੈੱਲ ਜਾਂ ਸਾਇਟੋਟੌਕਸਿਕ ਲਿਮਫੋਸਾਈਟਸ (CTLs) ਵੀ ਕਿਹਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਉਹ ਵਾਇਰਸ ਨਾਲ ਸੰਕਰਮਿਤ ਸੈੱਲਾਂ ਅਤੇ ਕੈਂਸਰ ਸੈੱਲਾਂ ਨੂੰ ਪਛਾਣਨ ਅਤੇ ਹਟਾਉਣ ਲਈ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹਨ। CTLs ਵਿੱਚ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਕੰਪਾਰਟਮੈਂਟ, ਜਾਂ ਗ੍ਰੈਨਿਊਲ ਹੁੰਦੇ ਹਨ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਸਾਈਟੋਟੌਕਸਿਨ ਹੁੰਦੇ ਹਨ ਜੋ ਐਪੋਪਟੋਸਿਸ ਦਾ ਕਾਰਨ ਬਣਦੇ ਹਨ, ਭਾਵ, ਪ੍ਰੋਗ੍ਰਾਮਡ ਸੈੱਲ ਦੀ ਮੌਤ। ਇਸਦੀ ਸ਼ਕਤੀ ਦੇ ਕਾਰਨ, ਦਾਣਿਆਂ ਦੀ ਰਿਹਾਈ ਨੂੰ ਇਮਿਊਨ ਸਿਸਟਮ ਦੁਆਰਾ ਸਖਤੀ ਨਾਲ ਨਿਯੰਤ੍ਰਿਤ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ।

ਚਾਰ ਪ੍ਰਮੁੱਖ CD4+ ਟੀ-ਸੈੱਲ ਸਬਸੈੱਟ ਹਨ TH1, TH2, TH17, ਅਤੇ Treg, "TH" ਦੇ ਨਾਲ "T ਸਹਾਇਕ ਸੈੱਲ" ਦਾ ਹਵਾਲਾ ਦਿੰਦੇ ਹਨ। TH1 ਸੈੱਲ ਅੰਦਰੂਨੀ ਰੋਗਾਣੂਆਂ, ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਬੈਕਟੀਰੀਆ ਦੇ ਵਿਰੁੱਧ ਪ੍ਰਤੀਰੋਧੀ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਦੇ ਤਾਲਮੇਲ ਲਈ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹਨ। ਉਹ ਅਣੂ ਪੈਦਾ ਕਰਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਛੁਪਾਉਂਦੇ ਹਨ ਜੋ ਹੋਰ ਇਮਿਊਨ ਸੈੱਲਾਂ ਨੂੰ ਸੁਚੇਤ ਅਤੇ ਸਰਗਰਮ ਕਰਦੇ ਹਨ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਬੈਕਟੀਰੀਆ-ਇੰਜੈਸਟਿੰਗ ਮੈਕਰੋਫੈਜ। TH2 ਸੈੱਲ ਬੀ ਸੈੱਲਾਂ, ਗ੍ਰੈਨੂਲੋਸਾਈਟਸ, ਅਤੇ ਮਾਸਟ ਸੈੱਲਾਂ ਨੂੰ ਸੁਚੇਤ ਕਰਕੇ, ਬਾਹਰਲੇ ਜਰਾਸੀਮ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਹੈਲਮਿੰਥਸ (ਪਰਜੀਵੀ ਕੀੜੇ) ਦੇ ਵਿਰੁੱਧ ਪ੍ਰਤੀਰੋਧੀ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਦਾ ਤਾਲਮੇਲ ਕਰਨ ਲਈ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹਨ। TH17 ਸੈੱਲਾਂ ਦਾ ਨਾਮ ਇੰਟਰਲਿਊਕਿਨ 17 (IL-17) ਪੈਦਾ ਕਰਨ ਦੀ ਉਹਨਾਂ ਦੀ ਯੋਗਤਾ ਲਈ ਰੱਖਿਆ ਗਿਆ ਹੈ, ਇੱਕ ਸੰਕੇਤਕ ਅਣੂ ਜੋ ਇਮਿਊਨ ਅਤੇ ਗੈਰ-ਇਮਿਊਨ ਸੈੱਲਾਂ ਨੂੰ ਸਰਗਰਮ ਕਰਦਾ ਹੈ। TH17 ਸੈੱਲ ਨਿਊਟ੍ਰੋਫਿਲਸ ਦੀ ਭਰਤੀ ਲਈ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹਨ।

ਰੈਗੂਲੇਟਰੀ ਟੀ ਸੈੱਲ (ਟ੍ਰੇਗਸ), ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਨਾਮ ਤੋਂ ਪਤਾ ਲੱਗਦਾ ਹੈ, ਦੂਜੇ ਟੀ ਸੈੱਲਾਂ ਦੀ ਗਤੀਵਿਧੀ ਦੀ ਨਿਗਰਾਨੀ ਅਤੇ ਰੋਕਦੇ ਹਨ। ਉਹ ਪ੍ਰਤੀਕੂਲ ਇਮਿਊਨ ਐਕਟੀਵੇਸ਼ਨ ਨੂੰ ਰੋਕਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਸਹਿਣਸ਼ੀਲਤਾ ਨੂੰ ਬਰਕਰਾਰ ਰੱਖਦੇ ਹਨ, ਜਾਂ ਸਰੀਰ ਦੇ ਆਪਣੇ ਸੈੱਲਾਂ ਅਤੇ ਐਂਟੀਜੇਨਾਂ ਦੇ ਵਿਰੁੱਧ ਪ੍ਰਤੀਰੋਧੀ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਦੀ ਰੋਕਥਾਮ ਕਰਦੇ ਹਨ।

ਇਮਿਊਨ ਸਹਿਣਸ਼ੀਲਤਾ ਵਿੱਚ ਸਹਿਣਸ਼ੀਲਤਾ ਬਾਰੇ ਹੋਰ ਪੜ੍ਹੋ।


ਚਰਚਾ

ਅਸੀਂ ਦਿੱਤੇ ਗਏ HLA ਕਲਾਸ I ਐਲੀਲ ਨਾਲ ਸੰਬੰਧਿਤ ਸੁਰੱਖਿਆ ਜਾਂ ਸੰਵੇਦਨਸ਼ੀਲਤਾ ਲਈ ਜ਼ਿੰਮੇਵਾਰ ਇਮਿਊਨ ਪਰਸਪਰ ਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਵਿੱਚ ਮਦਦ ਕਰਨ ਲਈ, ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਮੰਨਣਯੋਗ ਸਮਾਨਤਾ ਮੈਟ੍ਰਿਕਸ ਦੇ ਆਧਾਰ 'ਤੇ ਇੱਕ ਪਹੁੰਚ ਵਿਕਸਿਤ ਕੀਤੀ ਹੈ। ਪਹਿਲਾਂ ਅਸੀਂ 3 ਵਾਇਰਲ ਇਨਫੈਕਸ਼ਨਾਂ ਵਿੱਚ HLA ਰੋਗ ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨਾਂ ਦੀ ਜਾਂਚ ਕਰਨ ਲਈ ਇਸ ਪਹੁੰਚ ਨੂੰ ਲਾਗੂ ਕੀਤਾ। ਅਸੀਂ 6 ਐਲੀਲ ਸਮੂਹਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਕੁੱਲ 11 HLA ਐਲੀਲਾਂ ਦਾ ਅਧਿਐਨ ਕੀਤਾ। ਹਰ ਮਾਮਲੇ ਵਿੱਚ, ਦੇ ਅਪਵਾਦ ਦੇ ਨਾਲ ਬੀ*53:01 HIV-1 ਦੀ ਲਾਗ (ਜਿੱਥੇ ਸਾਡੇ ਕੋਲ TCR, iKIR ਅਤੇ aKIR ਦਾ ਅਧਿਐਨ ਕਰਨ ਲਈ ਨਾਕਾਫ਼ੀ ਸ਼ਕਤੀ ਸੀ) ਵਿੱਚ ਅਸੀਂ ਸੁਰੱਖਿਆ ਜਾਂ ਨੁਕਸਾਨਦੇਹ ਪ੍ਰਭਾਵ ਦੇ ਸਭ ਤੋਂ ਸੰਭਾਵਿਤ ਕਾਰਨਾਂ ਦੀ ਸਫਲਤਾਪੂਰਵਕ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਦੇ ਯੋਗ ਸੀ। HTLV-1 ਸੰਕਰਮਣ ਵਿੱਚ, ਪੈਟਰਨ ਅਨੋਖੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਤਿੱਖਾ ਸੀ। TCR ਬਾਈਡਿੰਗ ਦੁਆਰਾ ਸਾਰੇ 4 HLA ਰੋਗ ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨਾਂ ਨੂੰ ਸਭ ਤੋਂ ਵਧੀਆ ਸਮਝਾਇਆ ਗਿਆ ਸੀ। ਇਹ ਪੈਟਰਨ ਅਸਲ ਵਿੱਚ ਸਾਰੇ ਐਚਐਲਏ ਐਲੀਲਾਂ ਤੱਕ ਫੈਲਿਆ ਹੋਇਆ ਹੈ, ਇੱਕ ਐਲੀਲ ਦੁਆਰਾ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕੀਤੀ ਸੁਰੱਖਿਆ ਅਤੇ ਸਮਾਨ ਟੀਸੀਆਰ ਬਾਈਡਿੰਗ ਵਾਲੇ ਐਲੀਲਾਂ ਦੁਆਰਾ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕੀਤੀ ਸੁਰੱਖਿਆ ਦੇ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਬਹੁਤ ਮਜ਼ਬੂਤ ​​ਸਬੰਧ ਹੈ। ਇਹ ਇੱਕ ਪੂਰੀ ਤਰ੍ਹਾਂ ਨਾਲ ਅਚਾਨਕ ਨਤੀਜਾ ਹੈ ਜੋ ਇਹ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ ਕਿ, HTLV-1 ਦੀ ਲਾਗ ਵਿੱਚ, ਸਾਰੇ HLA ਐਲੀਲਾਂ ਦੁਆਰਾ ਸੁਰੱਖਿਆ ਨੂੰ ਨਿਰਧਾਰਤ ਕਰਨ ਵਿੱਚ ਸਭ ਤੋਂ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਇਮਿਊਨ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆ ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਸੀਡੀ8 + ਟੀ ਸੈੱਲ ਪ੍ਰਤੀਕਿਰਿਆ ਹੈ। HIV-1 ਦੀ ਲਾਗ ਵਿੱਚ, ਤਸਵੀਰ ਵਧੇਰੇ ਸੰਤੁਲਿਤ ਸੀ. ਦਾ ਸੁਰੱਖਿਆ ਪ੍ਰਭਾਵ ਬੀ*57:01, ਬੀ*57:02 ਅਤੇ ਬੀ*57:03 ਮੁੱਖ ਤੌਰ 'ਤੇ TCR ਬਾਈਡਿੰਗ ਦੇ ਕਮਜ਼ੋਰ ਪ੍ਰਭਾਵ ਲਈ ਸਬੂਤ ਦੇ ਨਾਲ aKIR ਦੇ ਕਾਰਨ ਸੀ। ਸਾਰੇ ਐਲੀਲਾਂ ਵਿੱਚ HLA-ਵਿਚੋਲੇ ਸੁਰੱਖਿਆ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਨ ਦੀ ਡਿਗਰੀ ਲਈ ਕੋਈ ਵੀ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ ਜ਼ਿੰਮੇਵਾਰ ਨਹੀਂ ਸੀ। ਐਚਸੀਵੀ ਦੀ ਲਾਗ ਵਿੱਚ ਬੀ*57 ਐਲੀਲ ਵੀ ਸੁਰੱਖਿਆਤਮਕ ਸਨ, ਪਰ ਅਚਾਨਕ HIV-1 ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਵੱਖਰੇ ਕਾਰਨ ਕਰਕੇ। HIV-1 ਦੀ ਲਾਗ ਦੇ ਉਲਟ, ਇਸ ਗੱਲ ਦਾ ਕੋਈ ਸਬੂਤ ਨਹੀਂ ਸੀ ਕਿ ਸੁਰੱਖਿਆ aKIR ਦੇ ਕਾਰਨ ਸੀ ਇਸਦੀ ਬਜਾਏ TCR ਬਾਈਡਿੰਗ ਮੁੱਖ ਨਿਰਣਾਇਕ ਜਾਪਦੀ ਹੈ। ਅਸੀਂ ਫਿਰ AH8.1 ਹੈਪਲੋਟਾਈਪ ਦੇ ਕਲਾਸੀਕਲ HLA ਕਲਾਸ I ਐਲੀਲਾਂ ਅਤੇ ਕਰੋਹਨ ਦੀ ਬਿਮਾਰੀ ਦੇ ਮਾਮਲਿਆਂ ਵਿੱਚ ਚੰਗੇ ਪੂਰਵ-ਅਨੁਮਾਨ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਸਬੰਧ ਦੀ ਜਾਂਚ ਕਰਨ ਲਈ ਵਿਧੀ ਨੂੰ ਲਾਗੂ ਕੀਤਾ। ਨਤੀਜਾ ਤਸਵੀਰ ਬਹੁਤ ਸਪੱਸ਼ਟ ਸੀ: ਜਾਂਚ ਕੀਤੀ ਗਈ ਕਿਸੇ ਵੀ ਪ੍ਰਤੀਰੋਧਕ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ ਨੇ ਸੁਰੱਖਿਆ ਪ੍ਰਭਾਵ ਦੀ ਵਿਆਖਿਆ ਨਹੀਂ ਕੀਤੀ। ਅਸੀਂ ਇਹ ਸਿੱਟਾ ਕੱਢਦੇ ਹਾਂ ਕਿ ਜਾਂ ਤਾਂ HLA-B*08:01 ਅਤੇ C*07:01 ਇੱਕ ਸੁਰੱਖਿਆ ਐਲੀਲ ਨੂੰ ਚਿੰਨ੍ਹਿਤ ਕਰਦੇ ਹਨ ਪਰ ਉਹ ਆਪਣੇ ਆਪ ਸੁਰੱਖਿਆਤਮਕ ਨਹੀਂ ਹੁੰਦੇ ਹਨ ਜਾਂ ਉਹ ਆਪਣੇ ਰੀਸੈਪਟਰ ਬਾਈਡਿੰਗ ਤੋਂ ਸੁਤੰਤਰ ਇੱਕ ਵਿਧੀ ਦੁਆਰਾ ਸੁਰੱਖਿਆ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਬਹੁਤ ਸਾਰੇ ਅਧਿਐਨਾਂ ਨੇ ਦੱਸਿਆ ਹੈ ਕਿ AH8.1 ਹੈਪਲੋਟਾਈਪ ਕਮਜ਼ੋਰ ਇਮਿਊਨ ਐਕਟੀਵੇਸ਼ਨ ਨਾਲ ਜੁੜਿਆ ਹੋਇਆ ਹੈ, ਸ਼ਾਇਦ TCR ਸਿਗਨਲ ਟ੍ਰਾਂਸਡਕਸ਼ਨ ਮਾਰਗ (ਕੈਂਡੋਰ ਐਟ ਅਲ., 1995 ਲਿਓ ਐਟ ਅਲ., 1995 ਈਜੀਆ ਐਟ ਅਲ., 1991) ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਨੁਕਸ ਕਾਰਨ। ਸਾਡੇ ਸਿੱਟੇ ਨਾਲ ਸਹਿਮਤੀ ਵਿੱਚ ਕਿ HLA-B*08:01 ਅਤੇ C*07:01 ਨਾਲ ਸੰਬੰਧਿਤ ਸੁਰੱਖਿਆ ਉਹਨਾਂ ਦੇ ਰੀਸੈਪਟਰ ਬਾਈਡਿੰਗ ਦੇ ਕਾਰਨ ਨਹੀਂ ਹੈ।

ਇਹ ਨੋਟ ਕਰਨਾ ਦਿਲਚਸਪ ਹੈ ਕਿ ਐੱਚਆਈਵੀ -1 ਦੀ ਲਾਗ ਵਿੱਚ ਸਾਰੇ ਬੀ*57 ਉੱਚ ਕੈਰੀਅਰ ਬਾਰੰਬਾਰਤਾ ਵਾਲੇ ਐਲੀਲਜ਼ (B*57:01, B*57:02, B*57:03) ਜਿਸ ਸਮੂਹ ਦਾ ਅਸੀਂ ਅਧਿਐਨ ਕਰਦੇ ਹਾਂ ਅਤੇ ਦੂਜਿਆਂ ਦੇ ਕੰਮ (ਕੈਰਿੰਗਟਨ ਅਤੇ ਓ'ਬ੍ਰਾਇਨ, 2003 ਕਿਪੀਏਲਾ ਐਟ ਅਲ., 2004 ਕੋਸਟੇਲੋ ਐਟ ਅਲ., 1999 ਫੈਲੇ ਐਟ ਅਲ., 2007) ਦੋਵਾਂ ਵਿੱਚ ਸੁਰੱਖਿਆ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਹੋਏ ਹਨ। ਹਾਲਾਂਕਿ, ਐਚਸੀਵੀ ਦੀ ਲਾਗ ਵਿੱਚ, ਬੀ*57:02 ਅਤੇ ਬੀ*57:03 ਸੁਰੱਖਿਆਤਮਕ ਹਨ, ਪਰ ਸਬੂਤ ਹਨ ਬੀ*57:01-ਵਿਚੋਲੇ ਸੁਰੱਖਿਆ ਘੱਟ ਸਪੱਸ਼ਟ ਹੈ। ਬੀ*57:01 ਵੱਡੀ ਗਿਣਤੀ ਵਿੱਚ ਕੈਰੀਅਰਾਂ ਦੇ ਬਾਵਜੂਦ ਅਸੀਂ ਜਿਸ ਸਮੂਹ ਦਾ ਅਧਿਐਨ ਕਰਦੇ ਹਾਂ ਉਸ ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸੁਰੱਖਿਆਤਮਕ ਨਹੀਂ ਹੈ ਅਤੇ ਇਹ ਦੂਜਿਆਂ ਦੁਆਰਾ ਵੀ ਰਿਪੋਰਟ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ, ਉਦਾਹਰਨ ਲਈ, ਕੁਨੀਹੋਲਮ ਐਟ ਅਲ। ਦੋਵੇਂ ਲੱਭੇ ਬੀ*57:01 ਅਤੇ ਬੀ*57:03 ਇੱਕ ਯੂਨੀਵਰੀਏਟ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਵਿੱਚ ਸੁਰੱਖਿਆਤਮਕ ਸਨ ਪਰ ਇੱਕ ਬਹੁ-ਵਿਭਿੰਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਵਿੱਚ ਬੀ*57:01 ਗਵਾਚੀ ਮਹੱਤਤਾ (ਸੰਭਾਵਤ ਤੌਰ 'ਤੇ ਹੋਰ ਐਚਐਲਏ ਐਲੀਲਾਂ ਨਾਲ ਸਬੰਧ ਹੋਣ ਕਾਰਨ) ਜਦੋਂ ਕਿ ਬੀ*57:03 ਬਰਕਰਾਰ ਮਹੱਤਤਾ (ਕੁਨੀਹੋਲਮ ਐਟ ਅਲ., 2013)। ਸਾਡੇ ਮੈਟ੍ਰਿਕਸ ਇਸ ਵਿਭਿੰਨ ਵਿਵਹਾਰ ਲਈ ਸਪੱਸ਼ਟੀਕਰਨ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਅੰਸ਼ ਸਾਂਝੇ ਕੀਤੇ ਮੈਟ੍ਰਿਕਸ ਸਾਰੇ ਦਿਲਚਸਪੀ ਦੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ 'ਤੇ ਨਿਰਭਰ ਕਰਦੇ ਹਨ। HIV-1 ਪ੍ਰੋਟੀਓਮ ਲਈ, ਸਾਰੇ ਬੀ*57 ਐਲੀਲ ਬਹੁਤ ਸਮਾਨ ਹੁੰਦੇ ਹਨ (ਉਦਾਹਰਨ ਲਈ ਜਦੋਂ ਸੂਚਕਾਂਕ ਬੀ*57:02 ਦੇ ਨਾਲ TCR.FS ਬੀ*57:01 0.74 ਹੈ ਅਤੇ ਸਿਰਫ 2 ਐਲੀਲਜ਼ -ਬੀ*58:02 ਅਤੇ ਬੀ*57:03- ਹੋਰ ਸਮਾਨ ਹਨ). HCV ਲਈ ਇਸਦੇ ਉਲਟ, ਜਦੋਂ ਕਿ ਬੀ*57:02 ਅਤੇ ਬੀ*57:03 ਸਮਾਨ ਹਨ, ਬੀ*57:01 ਜ਼ਿਆਦਾ ਦੂਰ ਹੈ (ਉਦਾਹਰਨ ਲਈ ਜਦੋਂ ਸੂਚਕਾਂਕ ਬੀ*57:02 ਦੇ ਨਾਲ TCR.FS ਬੀ*57:01 0.58 ਤੱਕ ਦੀਆਂ ਬੂੰਦਾਂ ਅਤੇ 10 ਐਲੀਲ ਹੋਰ ਸਮਾਨ ਹਨ ਬੀ*57:02 ਨਾਲੋਂ ਬੀ*57:01). ਇਹ ਇਸ ਦੇ ਕਾਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਸੁਚੱਜੀ ਵਿਆਖਿਆ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ ਬੀ*57:01 ਨੂੰ ਸੁਰੱਖਿਆ ਦੀ ਇੱਕ ਸਮਾਨ ਡਿਗਰੀ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ ਬੀ*57:02 ਅਤੇ ਬੀ*57:03 HIV-1 ਦੀ ਲਾਗ ਦੇ ਸੰਦਰਭ ਵਿੱਚ ਪਰ HCV ਦੀ ਲਾਗ ਦੇ ਸੰਦਰਭ ਵਿੱਚ ਘੱਟ ਸਮਾਨਤਾ ਜਾਪਦੀ ਹੈ। ਇਕ ਹੋਰ ਦਿਲਚਸਪ ਨਿਰੀਖਣ ਇਹ ਸੀ ਕਿ, ਤਿੰਨੋਂ ਵਾਇਰਲ ਇਨਫੈਕਸ਼ਨਾਂ ਲਈ, 'ਔਸਤ' ਐਲੀਲਾਂ ਦਾ ਰੈਂਕ ਆਰਡਰ ਮਜ਼ਬੂਤ ​​ਸੀ, ਯਾਨੀ, ਉਹਨਾਂ ਨੂੰ ਮਜ਼ਬੂਤੀ ਨਾਲ ਸੁਰੱਖਿਆ ਜਾਂ ਨੁਕਸਾਨਦੇਹ ਵਜੋਂ ਸ਼੍ਰੇਣੀਬੱਧ ਕੀਤਾ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ।

ਹਾਲਾਂਕਿ ਇੱਥੇ ਵੱਡੀ ਗਿਣਤੀ ਵਿੱਚ HLA ਕਲਾਸ I ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨਾਂ ਦੀ ਰਿਪੋਰਟ ਕੀਤੀ ਗਈ ਹੈ, ਇਹ ਪਤਾ ਨਹੀਂ ਹੈ ਕਿ ਇਹਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਕਿਸੇ ਵੀ ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨ ਲਈ ਕਿਹੜੀਆਂ ਇਮਿਊਨ ਪਰਸਪਰ ਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਜ਼ਿੰਮੇਵਾਰ ਹਨ ਇਸਲਈ ਕੋਈ 'ਗੋਲਡ ਸਟੈਂਡਰਡ' ਟੈਸਟ ਡੇਟਾ ਸੈੱਟ ਮੌਜੂਦ ਨਹੀਂ ਹੈ ਜਿਸ ਨਾਲ ਅਸੀਂ ਰਸਮੀ ਤੌਰ 'ਤੇ ਆਪਣੀ ਪਹੁੰਚ ਨੂੰ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਾਂ। ਹਾਲਾਂਕਿ, ਕਈ ਨਿਰੀਖਣਾਂ ਤੋਂ ਇਹ ਸੰਕੇਤ ਮਿਲਦਾ ਹੈ ਕਿ ਸਾਡੀ ਪਹੁੰਚ ਜੈਵਿਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਅਰਥਪੂਰਨ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰ ਰਹੀ ਹੈ। ਸਭ ਤੋਂ ਪਹਿਲਾਂ, TCR.FS ਮੈਟ੍ਰਿਕ ਨੇ ਪਾਇਆ ਹੈ ਕਿ ਇੱਕੋ ਸੁਪਰਟਾਈਪ ਦੇ ਅੰਦਰਲੇ ਐਲੀਲਾਂ ਸੁਪਰਟਾਈਪਾਂ (p=3×10 −7) ਵਿਚਕਾਰ ਐਲੀਲਾਂ ਨਾਲੋਂ ਵਧੇਰੇ ਸਮਾਨ ਹਨ (ਉੱਚਾ TCR.FS ਹੈ)। ਦੂਜਾ, HTLV-1 ਦੀ ਲਾਗ ਲਈ ਅਸੀਂ ਇੱਕ ਐਲੀਲ ਨਾਲ ਜੁੜੇ HAM/TSP ਦੇ ਜੋਖਮ ਅਤੇ ਸਮਾਨ ਐਲੀਲਾਂ (TCR.FS ਮੈਟ੍ਰਿਕ ਦੁਆਰਾ) ਨਾਲ ਜੁੜੇ HAM/TSP ਦੇ ਜੋਖਮ ਵਿਚਕਾਰ ਇੱਕ ਬਹੁਤ ਮਜ਼ਬੂਤ ​​ਸਕਾਰਾਤਮਕ ਸਬੰਧ ਲੱਭਦੇ ਹਾਂ। ਅਜਿਹਾ ਮਜ਼ਬੂਤ ​​ਸਬੰਧ ਬੇਤਰਤੀਬੇ ਦੁਆਰਾ ਪੈਦਾ ਹੋਣ ਦੀ ਸੰਭਾਵਨਾ ਨਹੀਂ ਹੈ। ਤੀਸਰਾ, HIV-1 ਦੀ ਲਾਗ ਵਿੱਚ ਅਸੀਂ ਪਾਇਆ ਕਿ KIR ਬਾਈਡਿੰਗ (aKIR.FS) ਨੂੰ ਸਰਗਰਮ ਕਰਨ ਦੇ ਮਾਮਲੇ ਵਿੱਚ ਸਮਾਨਤਾ ਨੇ ਰਵਾਇਤੀ ਅੰਦਰ ਗੁਆਚੀਆਂ ਡਾਕਟਰੀ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸੰਬੰਧਿਤ ਸੂਖਮਤਾਵਾਂ ਦਾ ਖੁਲਾਸਾ ਕੀਤਾ। KIR3DS1:Bw4-80I ਸੁਰੱਖਿਆਤਮਕ ਸਮੂਹ, ਜ਼ਰੂਰੀ ਤੌਰ 'ਤੇ ਇਸ ਸਮੂਹ ਨੂੰ 3 ਸਮੂਹਾਂ ਵਿੱਚ ਵੰਡਣ ਨਾਲ ਸੁਰੱਖਿਆ ਦੇ ਘਟਦੇ ਪੱਧਰਾਂ ਦੇ ਨਾਲ ਦੁਬਾਰਾ ਇਹ ਵੇਖਣਾ ਮੁਸ਼ਕਲ ਹੈ ਕਿ ਜੈਵਿਕ ਅਸਲੀਅਤ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਣ ਵਾਲੇ ਵਿਧੀ ਤੋਂ ਇਲਾਵਾ ਅਜਿਹਾ ਨਤੀਜਾ ਕਿਵੇਂ ਪੈਦਾ ਕੀਤਾ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ।

ਅਸੀਂ ਇਸ ਗੱਲ 'ਤੇ ਜ਼ੋਰ ਦਿੰਦੇ ਹਾਂ ਕਿ ਇਸ ਵਿਧੀ ਨੂੰ ਇਕੱਲੇ-ਇਕੱਲੇ ਢੰਗ ਨਾਲ ਨਹੀਂ ਵਰਤਿਆ ਜਾਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ ਕਿਉਂਕਿ ਇੱਕ HLA ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨ ਦੇ ਅੰਤਰਗਤ ਵਿਧੀ ਨੂੰ ਨਿਰਧਾਰਤ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕੋ ਇੱਕ ਵਿਧੀ ਹੈ। ਇਸ ਦੀ ਬਜਾਏ ਇਹ ਸਭ ਤੋਂ ਸੰਭਾਵਿਤ ਜਵਾਬ ਨੂੰ ਤਿਕੋਣਾ ਕਰਨ ਲਈ ਸਬੂਤ ਦੀਆਂ ਹੋਰ ਲਾਈਨਾਂ ਦੇ ਨਾਲ ਵਰਤੇ ਜਾਣ ਵਾਲੇ ਸਬੂਤ ਦੀ ਇੱਕ ਲਾਈਨ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਕਲਾਸੀਕਲ ਬਿਮਾਰੀ ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨ ਪਹੁੰਚ (ਜੋ ਪੂਰਵ-ਸੂਚਕ ਵਜੋਂ HLA ਐਲੀਲਾਂ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹਨ) ਦੇ ਨਾਲ ਸਾਂਝੇ ਤੌਰ 'ਤੇ, ਇਸ ਵਿਧੀ ਨੂੰ ਸਾਵਧਾਨੀ ਨਾਲ ਵਰਤਿਆ ਜਾਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ। ਕਲਾਸੀਕਲ ਐਚਐਲਏ ਰੋਗ ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨ ਅਧਿਐਨਾਂ ਵਿੱਚ ਪੈਦਾ ਹੋਣ ਵਾਲੀਆਂ ਬਹੁਤ ਸਾਰੀਆਂ ਸਮੱਸਿਆਵਾਂ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਲਿੰਕੇਜ ਅਸੰਤੁਲਨ, ਨਾਪਿਆ ਹੋਇਆ ਉਲਝਣ ਵਾਲੇ ਵੇਰੀਏਬਲ ਜਾਂ ਆਬਾਦੀ ਪੱਧਰੀਕਰਨ ਇਹਨਾਂ ਮੈਟ੍ਰਿਕਸ ਨਾਲ ਘੱਟ ਸਮੱਸਿਆ ਹੈ। ਇਹ ਇਸ ਲਈ ਹੈ ਕਿਉਂਕਿ ਬਹੁਤ ਸਾਰੇ ਐਲੀਲ ਸਮਾਨ ਹੋਣਗੇ ਅਤੇ ਸਮਾਨਤਾ ਮੈਟ੍ਰਿਕ ਵਿੱਚ ਯੋਗਦਾਨ ਪਾਉਣਗੇ ਅਤੇ ਇਹ ਸੰਭਾਵਨਾ ਨਹੀਂ ਹੈ ਕਿ ਸਾਰੇ ਮਿਲਦੇ-ਜੁਲਦੇ ਐਲੀਲਾਂ ਇੱਕੋ ਪੋਲੀਮੋਰਫਿਜ਼ਮ ਨਾਲ ਲਿੰਕੇਜ ਅਸੰਤੁਲਨ ਵਿੱਚ ਹੋਣਗੀਆਂ ਜਾਂ ਸਾਰੇ ਇੱਕੋ ਕਨਫਾਊਂਡਰ ਨਾਲ ਸਬੰਧਿਤ ਹੋਣਗੀਆਂ। ਫਿਰ ਵੀ ਲਿੰਕੇਜ ਅਸੰਤੁਲਨ ਅਤੇ ਹੋਰ ਸਬੰਧ ਨਤੀਜਿਆਂ ਨੂੰ ਵਿਗਾੜ ਸਕਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਇਸਦੀ ਜਾਂਚ ਕੀਤੀ ਜਾਣੀ ਚਾਹੀਦੀ ਹੈ। ਸੰਖੇਪ ਵਿੱਚ, ਵਿਧੀ ਨੂੰ ਅੰਨ੍ਹੇਵਾਹ ਨਹੀਂ ਵਰਤਿਆ ਜਾਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ, ਇਸਦੀ ਵਰਤੋਂ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਸਮੱਸਿਆ ਅਤੇ ਡੇਟਾਸੈਟ ਦੀ ਬਣਤਰ ਦੋਵਾਂ ਦੇ ਗਿਆਨ ਵਾਲੇ ਕਿਸੇ ਵਿਅਕਤੀ ਦੁਆਰਾ ਧਿਆਨ ਨਾਲ ਕੀਤੀ ਜਾਣੀ ਚਾਹੀਦੀ ਹੈ। ਇਸ ਪਹੁੰਚ ਦੀ ਇੱਕ ਹੋਰ ਸੀਮਾ KIR ਬਾਈਡਿੰਗ ਸਮੂਹਾਂ ਦੀ ਮੁਕਾਬਲਤਨ ਸਰਲ ਪਰਿਭਾਸ਼ਾ ਹੈ ਜੋ KIR ਐਲੀਲ ਜਾਂ KIR-HLA ਬਾਈਡਿੰਗ ਵਿੱਚ ਭਿੰਨਤਾਵਾਂ ਨੂੰ ਧਿਆਨ ਵਿੱਚ ਨਹੀਂ ਰੱਖਦੀ ਜੋ C1/C2 ਅਤੇ Bw4/Bw6 ਨਿਯਮਾਂ ਨੂੰ ਤੋੜਦੀ ਹੈ। ਫਿਰ ਵੀ, ਇਹ ਸਰਲ ਸਮੂਹਿਕਤਾ ਹੋਰ ਅਧਿਐਨਾਂ ਵਿੱਚ ਬਹੁਤ ਸ਼ਕਤੀਸ਼ਾਲੀ ਸਾਬਤ ਹੋਈ ਹੈ (ਮਾਰਟਿਨ ਐਟ ਅਲ., 2007 ਮਾਰਟਿਨ ਐਟ ਅਲ., 2002 ਪੇਲਕ ਐਟ ਅਲ., 2011 ਵਿੰਸ ਐਟ ਅਲ., 2014 ਖਾਕੂ ਐਟ ਅਲ., 2004 ਅਹਿਲਨਸਟੀਏਲ ਐਟ ਅਲ., 2008 et al., 2015), ਇਹ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ ਕਿ, ਪਹਿਲੇ ਅਨੁਮਾਨ ਤੱਕ, ਉਹ ਜਾਣਕਾਰੀ ਭਰਪੂਰ ਹਨ।

ਅਸੀਂ ਸਾਰੇ ਜਾਣੇ-ਪਛਾਣੇ ਰੀਸੈਪਟਰ-ਐਚਐਲਏ ਪਰਸਪਰ ਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਦਾ ਅਧਿਐਨ ਨਹੀਂ ਕਰਦੇ ਹਾਂ ਇਸ ਦੀ ਬਜਾਏ ਅਸੀਂ ਰੀਸੈਪਟਰ-ਲਿਗੈਂਡ ਜੋੜਿਆਂ 'ਤੇ ਕੇਂਦ੍ਰਤ ਕਰਦੇ ਹਾਂ ਜੋ ਪੌਲੀਮੋਰਫਿਕ ਅਤੇ ਚੰਗੀ ਤਰ੍ਹਾਂ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਵਾਲੇ ਹਨ। ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਅਸੀਂ TCR-HLA:ਪੇਪਟਾਈਡ, ਨਿਰੋਧਕ KIR-HLA:ਪੇਪਟਾਇਡ, ਐਕਟੀਵੇਟਿੰਗ KIR-HLA:ਪੇਪਟਾਇਡ, LILRB1-HLA ਅਤੇ LILRB2-HLA ਦੀ ਜਾਂਚ ਕਰਦੇ ਹਾਂ। ਹੋਰ ਰੀਸੈਪਟਰਾਂ-ਲਿਗੈਂਡ ਪਰਸਪਰ ਕ੍ਰਿਆਵਾਂ ਨੂੰ ਸ਼ਾਮਲ ਕਰਨਾ ਉਸੇ ਪਹੁੰਚ ਦੀ ਪਾਲਣਾ ਕਰੇਗਾ ਪਰ ਵਧੇਰੇ ਡੇਟਾ ਅਤੇ ਰੀਸੈਪਟਰਾਂ ਦੀ ਬਿਹਤਰ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਦੀ ਲੋੜ ਹੈ। ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਅਸੀਂ CD94:NKG2A-HLA ਪਰਸਪਰ ਕ੍ਰਿਆ ਦੀ ਜਾਂਚ ਨਹੀਂ ਕੀਤੀ ਕਿਉਂਕਿ, ਮੌਜੂਦਾ ਗਿਆਨ ਦੇ ਨਾਲ, ਅਸੀਂ ਸਿਰਫ ਐਲੀਲਾਂ ਨੂੰ ਬਾਈਨਰੀ ਫੈਸ਼ਨ ਵਿੱਚ ਬਾਈਂਡਰ ਜਾਂ ਗੈਰ-ਬਾਈਂਡਰ ਵਿੱਚ ਵੰਡ ਸਕਦੇ ਹਾਂ ਜੋ ਬਾਅਦ ਦੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਵਿੱਚ ਕੋਈ ਸ਼ਕਤੀ ਪ੍ਰਦਾਨ ਨਹੀਂ ਕਰਨਗੇ। ਬਾਈਡਿੰਗ ਦੀ ਤਾਕਤ ਇਸ ਤੋਂ ਵੱਧ ਸੂਖਮ ਹੋਣ ਲਈ ਜਾਣੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ ਅਤੇ CD94 ਅਤੇ NKG2A (Petrie et al., 2008) ਦੋਵਾਂ ਨਾਲ ਪੇਪਟਾਇਡ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ 'ਤੇ ਨਿਰਭਰ ਕਰਦੀ ਹੈ ਪਰ ਇਸ ਬਾਈਡਿੰਗ ਨੂੰ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਦੇਣ ਲਈ ਕੋਈ ਵਿਆਪਕ ਡੇਟਾ ਨਹੀਂ ਹੈ। ਅਸੀਂ ਐਚ.ਐਲ.ਏ. ਦੇ ਅਣੂਆਂ (ਇਲਾਹੀ ਐਟ ਅਲ., 2011) ਦੇ ਅਸਧਾਰਨ ਪ੍ਰਭਾਵਾਂ ਦਾ ਅਧਿਐਨ ਨਹੀਂ ਕਰਦੇ ਹਾਂ। ਮੋਨੋਮੋਰਫਿਕ ਰੀਸੈਪਟਰ-ਲਿਗੈਂਡ ਜੋੜਿਆਂ ਦਾ ਅਧਿਐਨ ਨਹੀਂ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ ਕਿਉਂਕਿ ਇਹ ਪੋਲੀਮੋਰਫਿਕ ਐਚਐਲਏ ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨਾਂ ਦੀ ਵਿਆਖਿਆ ਨਹੀਂ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ।

HLA ਕਲਾਸ I ਰੋਗ ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨਾਂ ਦੇ ਅਧੀਨ ਇਮਿਊਨ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਦੇ ਨਾਲ-ਨਾਲ ਇਸ ਪਹੁੰਚ ਨੂੰ ਕਲਾਸੀਕਲ GWAS ਜਾਂ ਉਮੀਦਵਾਰ ਜੀਨ ਪਹੁੰਚਾਂ ਦੇ ਨਾਲ ਪਛਾਣਿਆ HLA ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨਾਂ ਦੀ ਜਾਂਚ ਲਈ ਇੱਕ ਸਾਧਨ ਵਜੋਂ ਵਰਤਿਆ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ। 'ਨੇੜੇ' ਐਲੀਲਾਂ ਅਤੇ ਨਤੀਜੇ ਵਿਚਕਾਰ ਸਬੰਧ ਦੀ ਘਾਟ ਇਹ ਸੰਕੇਤ ਦੇ ਸਕਦੀ ਹੈ ਕਿ ਪਛਾਣਿਆ ਗਿਆ ਐਲੀਲ ਇੱਕ ਯਾਤਰੀ ਹੈ ਜੋ ਕਾਰਕ ਰੂਪ ਜਾਂ ਗਲਤ ਸਕਾਰਾਤਮਕ ਨੂੰ ਚਿੰਨ੍ਹਿਤ ਕਰਦਾ ਹੈ।

ਸਾਡੀ ਪਹੁੰਚ ਐਚ.ਐਲ.ਏ. ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨਾਂ ਤੋਂ ਰਾਏਚੌਧਰੀ ਆਦਿ ਦੁਆਰਾ ਸਮਝ ਫੰਕਸ਼ਨ ਵੱਲ ਜਾਣ ਦੀ ਇੱਕ ਹੋਰ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਕੋਸ਼ਿਸ਼ ਤੋਂ ਵੱਖਰੀ ਹੈ। (2012)। ਰਾਇਚੌਧਰੀ ਐਟ ਅਲ ਨੇ ਰੋਗ ਦੇ ਲੱਛਣਾਂ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਐਲੀਲਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਦੀ ਆਮ ਪਹੁੰਚ ਨੂੰ ਵਧਾ ਦਿੱਤਾ ਹੈ ਅਤੇ ਇਸ ਦੀ ਬਜਾਏ ਬਾਰੀਕ ਮੈਪਡ ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨਾਂ ਨੂੰ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਦੇ ਪੱਧਰ ਤੱਕ ਹੇਠਾਂ ਕਰ ਦਿੱਤਾ ਹੈ। ਇਸ ਉੱਚ ਰੈਜ਼ੋਲੂਸ਼ਨ ਪਹੁੰਚ ਨੇ 5 ਐਮੀਨੋ ਐਸਿਡਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕੀਤੀ, ਸਾਰੇ ਐਚਐਲਏ ਅਣੂਆਂ ਦੇ ਪੇਪਟਾਇਡ ਬਾਈਡਿੰਗ ਗ੍ਰੋਵ ਵਿੱਚ, ਜੋ ਕਿ ਸੇਰੋਪੋਜ਼ਿਟਿਵ ਰਾਇਮੇਟਾਇਡ ਗਠੀਏ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਹੋਏ ਸਨ। ਹਾਲਾਂਕਿ, ਲੇਖਕਾਂ ਨੇ ਇਹ ਮੰਨਿਆ ਕਿ CD8 + T ਸੈੱਲ ਜਵਾਬ ਵਿੱਚ ਪਰਿਵਰਤਨ ਨੂੰ ਦੇਖਿਆ ਗਿਆ ਐਸੋਸੀਏਸ਼ਨਾਂ ਦੀ ਵਿਆਖਿਆ ਕਰਨੀ ਚਾਹੀਦੀ ਹੈ।

ਮਨੁੱਖੀ ਰੋਗਾਂ ਦੇ ਅਧਿਐਨ ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ਨਿਰੀਖਣ ਅਤੇ ਕੁਦਰਤ ਦੇ ਸਬੰਧ ਵਿੱਚ ਹੁੰਦੇ ਹਨ। ਇਸਦਾ ਇੱਕ ਅਪਵਾਦ ਜੈਨੇਟਿਕ ਐਸੋਸਿਏਸ਼ਨ ਅਧਿਐਨ ਹੈ ਜੋ ਕਾਰਕ ਕਾਰਕਾਂ ਨੂੰ ਉਜਾਗਰ ਕਰਨ ਦਾ ਇੱਕ ਦੁਰਲੱਭ ਅਤੇ ਸ਼ਕਤੀਸ਼ਾਲੀ ਮੌਕਾ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇੱਥੇ ਅਸੀਂ ਰੋਗ ਸੰਘਾਂ ਲਈ ਕੁਝ ਸਭ ਤੋਂ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਜੀਨਾਂ ਦੀ ਪੁੱਛਗਿੱਛ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਪਹੁੰਚ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੇ ਹਾਂ: HLA ਕਲਾਸ I ਜੀਨ। ਅੰਤ ਵਿੱਚ, ਕਾਰਕ ਕਾਰਕਾਂ ਨੂੰ ਜਾਣਨਾ ਬਿਮਾਰੀ ਦੇ ਜਰਾਸੀਮ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਅਣੂ ਮਾਰਗਾਂ ਦੀ ਬਿਹਤਰ ਸਮਝ ਵੱਲ ਅਗਵਾਈ ਕਰੇਗਾ ਅਤੇ ਸੰਭਾਵੀ ਇਲਾਜ ਦੇ ਟੀਚਿਆਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਵਿੱਚ ਮਦਦ ਕਰੇਗਾ।


ਫੈਗੋਸਾਈਟਸ ਦੀਆਂ ਕਿਸਮਾਂ

ਚਿੱਟੇ ਰਕਤਾਣੂਆਂ ਦੁਆਰਾ ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ਫਾਗੋਸਾਈਟੋਜ਼ ਕੀਤੇ ਕਣਾਂ ਵਿੱਚ ਬੈਕਟੀਰੀਆ, ਮਰੇ ਹੋਏ ਟਿਸ਼ੂ ਸੈੱਲ, ਪ੍ਰੋਟੋਜ਼ੋਆ, ਵੱਖ-ਵੱਖ ਧੂੜ ਦੇ ਕਣ, ਰੰਗਦਾਰ ਅਤੇ ਹੋਰ ਮਿੰਟ ਵਿਦੇਸ਼ੀ ਸਰੀਰ ਸ਼ਾਮਲ ਹੁੰਦੇ ਹਨ। ਮਨੁੱਖਾਂ ਵਿੱਚ, ਅਤੇ ਰੀੜ੍ਹ ਦੀ ਹੱਡੀ ਵਿੱਚ ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ, ਸਭ ਤੋਂ ਪ੍ਰਭਾਵੀ ਫੈਗੋਸਾਈਟਿਕ ਸੈੱਲ ਦੋ ਕਿਸਮ ਦੇ ਚਿੱਟੇ ਰਕਤਾਣੂ ਹੁੰਦੇ ਹਨ: ਮੈਕਰੋਫੈਜ (ਵੱਡੇ ਫੈਗੋਸਾਈਟਿਕ ਸੈੱਲ) ਅਤੇ ਨਿਊਟ੍ਰੋਫਿਲਜ਼ (ਗ੍ਰੈਨਿਊਲੋਸਾਈਟ ਦੀ ਇੱਕ ਕਿਸਮ)। ਮੈਕਰੋਫੈਜ ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਫੇਫੜਿਆਂ, ਜਿਗਰ, ਤਿੱਲੀ, ਅਤੇ ਲਿੰਫ ਨੋਡਸ ਵਿੱਚ ਹੁੰਦੇ ਹਨ, ਜਿੱਥੇ ਉਹਨਾਂ ਦਾ ਕੰਮ ਬੈਕਟੀਰੀਆ ਅਤੇ ਹੋਰ ਕਣਾਂ ਦੇ ਸਾਹ ਨਾਲੀਆਂ, ਖੂਨ ਅਤੇ ਲਿੰਫ ਨੂੰ ਮੁਕਤ ਕਰਨਾ ਹੁੰਦਾ ਹੈ। ਮੈਕਰੋਫੈਜ ਸਾਰੇ ਟਿਸ਼ੂਆਂ ਵਿੱਚ ਭਟਕਦੇ ਅਮੀਬੋਇਡ ਸੈੱਲਾਂ ਦੇ ਰੂਪ ਵਿੱਚ ਵੀ ਪਾਏ ਜਾਂਦੇ ਹਨ, ਅਤੇ ਮੋਨੋਸਾਈਟ, ਮੈਕਰੋਫੇਜ ਦਾ ਪੂਰਵਗਾਮੀ, ਖੂਨ ਵਿੱਚ ਪਾਇਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਛੋਟੇ ਫੈਗੋਸਾਈਟਸ ਮੁੱਖ ਤੌਰ 'ਤੇ ਨਿਊਟ੍ਰੋਫਿਲ ਹੁੰਦੇ ਹਨ ਜੋ ਸੰਚਾਰਿਤ ਖੂਨ ਦੁਆਰਾ ਉਦੋਂ ਤੱਕ ਲਿਜਾਏ ਜਾਂਦੇ ਹਨ ਜਦੋਂ ਤੱਕ ਉਹ ਸੰਕਰਮਿਤ ਟਿਸ਼ੂ ਦੇ ਖੇਤਰ ਤੱਕ ਨਹੀਂ ਪਹੁੰਚ ਜਾਂਦੇ, ਜਿੱਥੇ ਉਹ ਖੂਨ ਦੀਆਂ ਨਾੜੀਆਂ ਦੀ ਕੰਧ ਵਿੱਚੋਂ ਲੰਘਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਉਸ ਟਿਸ਼ੂ ਵਿੱਚ ਰਹਿੰਦੇ ਹਨ। ਬੈਕਟੀਰੀਆ ਅਤੇ ਸੰਕਰਮਿਤ ਟਿਸ਼ੂ ਦੁਆਰਾ ਦਿੱਤੇ ਗਏ ਪਦਾਰਥਾਂ ਦੁਆਰਾ ਜਾਂ ਬੈਕਟੀਰੀਆ ਅਤੇ ਖੂਨ ਦੇ ਸੀਰਮ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਪੂਰਕ ਪ੍ਰਣਾਲੀ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਇੱਕ ਰਸਾਇਣਕ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ ਦੁਆਰਾ ਦੋਵੇਂ ਮੈਕਰੋਫੈਜ ਅਤੇ ਨਿਊਟ੍ਰੋਫਿਲ ਸੰਕਰਮਣ ਜਾਂ ਸੋਜਸ਼ ਦੇ ਖੇਤਰ ਵੱਲ ਖਿੱਚੇ ਜਾਂਦੇ ਹਨ। ਨਿਊਟ੍ਰੋਫਿਲਜ਼ ਅਚਾਨਕ ਉਹਨਾਂ ਨਾਲ ਟਕਰਾਉਣ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਕਣਾਂ ਨੂੰ ਘੇਰ ਸਕਦੇ ਹਨ।


ਸਹਾਇਕ ਜਾਣਕਾਰੀ

S1 ਫਾਈਲ। ਸਹਾਇਕ ਜਾਣਕਾਰੀ।

ਚਿੱਤਰ A. TNF- α/IL-10 ਸਾਈਟੋਕਾਈਨ ਇੰਡਕਸ਼ਨ ਅਨੁਪਾਤ। ਚਿੱਤਰ B. ਦਾ ਚਾਂਦੀ ਦਾ ਧੱਬਾ . muciniphila ਐਲ.ਪੀ.ਐਸ. Fig C. TLR2 ਐਸੀਟੇਟ ਅਤੇ ਪ੍ਰੋਪੀਓਨੇਟ ਦਾ ਸੰਕੇਤ। ਦੇ ਸ਼ੁੱਧ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਵਿੱਚ TEER ਵਿਕਾਸ . muciniphila. ਟੇਬਲ A. ਪਲਾਜ਼ਮੀਡ ਨਿਰਮਾਣ ਲਈ ਵਰਤੇ ਜਾਂਦੇ PCR-ਪ੍ਰਾਈਮਰ। ਸਾਰਣੀ B. ਮਨੁੱਖੀ HEK-ਬਲੂ hTLR2/4/5/9/NOD2 ਸੈੱਲ ਲਾਈਨਾਂ ਲਈ ਬੀਜੇ ਗਏ ਸੈੱਲਾਂ ਦੀ ਸੰਖਿਆ।

S1 ਡਾਟਾਸੈੱਟ। ਦਾ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ A. muciniphila ਸੁਕਰੋਜ਼ ਘਣਤਾ-ਗਰੇਡੀਐਂਟ ਫਰੈਕਸ਼ਨ।

ਨਤੀਜਿਆਂ ਨੂੰ ਲੌਗ10 ਲੇਬਲ-ਮੁਕਤ ਮਾਤਰਾ (LFQ) ਤੀਬਰਤਾ ਦੇ ਰੂਪ ਵਿੱਚ ਪੇਸ਼ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਗੈਰ-ਮੌਜੂਦਾ LFQ ਤੀਬਰਤਾ ਮੁੱਲਾਂ ਨੂੰ ਕਾਫ਼ੀ ਮਾਤਰਾ ਵਿੱਚ ਨਾ ਹੋਣ ਕਾਰਨ ਪੈਪਟਾਇਡਸ ਮੁੱਲ 3.5 ਨਾਲ ਬਦਲਿਆ ਗਿਆ ਸੀ।


ਸਕੂਲ ਆਫ਼ ਮੈਡੀਸਨ ਕੋਲੰਬੀਆ

ਅਸੀਂ ਮੁੱਖ ਤੌਰ 'ਤੇ ਅਧਿਆਪਨ, ਖੋਜ ਅਤੇ ਸੇਵਾ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਹਾਂ। ਸਾਡੀ ਖੋਜ ਨੂੰ ਸੰਘੀ ਸਰੋਤਾਂ ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਨੈਸ਼ਨਲ ਇੰਸਟੀਚਿਊਟ ਆਫ਼ ਹੈਲਥ ਅਤੇ ਪ੍ਰਾਈਵੇਟ ਫਾਊਂਡੇਸ਼ਨਾਂ ਤੋਂ ਗ੍ਰਾਂਟ ਸਹਾਇਤਾ ਦੁਆਰਾ ਚੰਗੀ ਤਰ੍ਹਾਂ ਫੰਡ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਅਜਿਹੇ ਸਮਰਥਨ ਦੇ ਨਤੀਜੇ ਵਜੋਂ ਵਿਗਿਆਨਕ ਰਸਾਲਿਆਂ ਵਿੱਚ ਉੱਚ-ਗੁਣਵੱਤਾ ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਨ ਦੇ ਨਾਲ-ਨਾਲ ਖੇਤਰੀ, ਰਾਸ਼ਟਰੀ ਅਤੇ ਅੰਤਰਰਾਸ਼ਟਰੀ ਕਾਨਫਰੰਸਾਂ ਵਿੱਚ ਪੇਸ਼ਕਾਰੀਆਂ ਹੋਈਆਂ ਹਨ।

ਅੰਤਰ-ਅਨੁਸ਼ਾਸਨੀ ਪਹੁੰਚ

ਸਾਡਾ ਵਿਭਾਗ ਸਾਡੇ ਸਕੂਲ, ਯੂਨੀਵਰਸਿਟੀ ਅਤੇ ਇਸ ਤੋਂ ਬਾਹਰ ਦੇ ਹੋਰਾਂ ਦੇ ਨਾਲ ਅੰਤਰ-ਅਨੁਸ਼ਾਸਨੀ ਅਤੇ ਬਹੁ-ਅਨੁਸ਼ਾਸਨੀ ਖੋਜ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟਾਂ 'ਤੇ ਸਹਿਯੋਗ ਲਈ ਅਨੁਕੂਲ ਇੱਕ ਉੱਚ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵੀ ਖੋਜ ਵਾਤਾਵਰਣ ਦੀ ਪੇਸ਼ਕਸ਼ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਅਸਧਾਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਫੰਡ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕੇਂਦਰ ਅਤੇ ਪ੍ਰੋਗਰਾਮ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਗ੍ਰਾਂਟਾਂ ਦੁਆਰਾ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਹੈ।

ਸੇਵਾ

ਸਾਡੀ ਫੈਕਲਟੀ ਸਿੱਧੀ ਅਤਿ-ਆਧੁਨਿਕ ਕੋਰ ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਫਲੋ ਸਾਇਟੋਮੈਟਰੀ ਅਤੇ ਛਾਂਟੀ। ਸਾਡੇ ਹੋਰ ਸਾਂਝੇ ਸਰੋਤਾਂ ਵਿੱਚ ਐਡਵਾਂਸਡ ਮਾਈਕ੍ਰੋਸਕੋਪੀ, –ਓਮਿਕਸ (ਜੀਨੋਮਿਕਸ, ਐਪੀਜੀਨੋਮਿਕਸ, ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੌਮਿਕਸ ਅਤੇ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ ਟੈਕਨਾਲੋਜੀ) ਅਤੇ ਮੈਟਾਬੋਲਿਕ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਿੰਗ ਅਧਿਐਨਾਂ ਲਈ ਅਤਿ-ਆਧੁਨਿਕ ਉਪਕਰਣ ਅਤੇ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ। ਸਾਡੇ ਸਾਜ਼ੋ-ਸਾਮਾਨ ਅਤੇ ਸਰੋਤਾਂ ਨੂੰ ਪਹਿਲੀ ਵਾਰ ਦੇਖਣ ਲਈ ਅਸੀਂ ਤੁਹਾਡਾ ਸਵਾਗਤ ਕਰਦੇ ਹਾਂ।

ਫੈਕਲਟੀ

ਸਾਡੇ ਫੈਕਲਟੀ ਆਪਣੇ ਖੇਤਰਾਂ ਵਿੱਚ ਮਾਨਤਾ ਪ੍ਰਾਪਤ ਆਗੂ ਹਨ। ਉਹ ਰਾਸ਼ਟਰੀ ਅਤੇ ਅੰਤਰਰਾਸ਼ਟਰੀ ਗ੍ਰਾਂਟ-ਸਮੀਖਿਆ ਕਮੇਟੀਆਂ ਵਿੱਚ ਨਿਯੁਕਤ ਕੀਤੇ ਜਾਂਦੇ ਹਨ, ਵਿਗਿਆਨਕ ਸੋਸਾਇਟੀਆਂ ਵਿੱਚ ਦਫਤਰ ਰੱਖਦੇ ਹਨ, ਕਾਨਫਰੰਸਾਂ ਦਾ ਆਯੋਜਨ ਕਰਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਸਰਕਾਰ ਦੁਆਰਾ ਨਿਯੁਕਤ ਪੈਨਲਾਂ ਅਤੇ ਵਿਗਿਆਨਕ ਜਰਨਲ ਸੰਪਾਦਕੀ ਬੋਰਡਾਂ ਵਿੱਚ ਸੇਵਾ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਉਹ ਮੁੱਖ ਤੌਰ 'ਤੇ ਮੈਡੀਕਲ ਅਤੇ ਗ੍ਰੈਜੂਏਟ ਵਿਦਿਆਰਥੀਆਂ ਦੇ ਨਾਲ-ਨਾਲ ਪੋਸਟ-ਬੈਕਲੋਰੀਏਟ ਅਤੇ ਫਿਜ਼ੀਸ਼ੀਅਨ ਅਸਿਸਟੈਂਟ ਵਿਦਿਆਰਥੀਆਂ ਲਈ ਅਧਿਆਪਨ ਕੋਰਸਾਂ ਵਿੱਚ ਹਿੱਸਾ ਲੈਂਦੇ ਹਨ।

ਕੋਰ ਕੋਰਸ

ਸੱਤ-ਕ੍ਰੈਡਿਟ-ਘੰਟੇ, ਪਤਝੜ ਸਮੈਸਟਰ, ਦੂਜੇ-ਸਾਲ ਦਾ ਕੋਰਸ ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਓਲੋਜੀ ਅਤੇ ਇਮਯੂਨੋਲੋਜੀ ਦੇ ਬੁਨਿਆਦੀ ਅਤੇ ਕਲੀਨਿਕਲ ਪਹਿਲੂਆਂ ਨੂੰ ਕਵਰ ਕਰਦਾ ਹੈ ਕਿਉਂਕਿ ਉਹ ਬੈਕਟੀਰੀਆ, ਵਾਇਰਸ, ਫੰਜਾਈ ਅਤੇ ਪਰਜੀਵੀਆਂ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਹਨ। ਛੂਤ ਵਾਲੇ ਏਜੰਟਾਂ ਦੀ ਉਹਨਾਂ ਦੇ ਰੂਪ ਵਿਗਿਆਨ, ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ, ਮਹਾਂਮਾਰੀ ਵਿਗਿਆਨ ਅਤੇ ਰੋਗਾਣੂ-ਵਿਗਿਆਨ ਦੇ ਸਬੰਧ ਵਿੱਚ ਚਰਚਾ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ।

ਲਾਗ ਅਤੇ ਬਿਮਾਰੀ ਦੇ ਵਿਰੁੱਧ ਬਚਾਅ ਵਿੱਚ ਖਾਸ ਅਤੇ ਗੈਰ-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਇਮਿਊਨ ਸਿਸਟਮ ਦੀ ਭੂਮਿਕਾ, ਅਤੇ ਨਾਲ ਹੀ ਬਿਮਾਰੀ ਦੇ ਕਾਰਨ (ਇਮਯੂਨੋਪੈਥੋਜੇਨੇਸਿਸ) ਵਿੱਚ ਜ਼ੋਰ ਦਿੱਤਾ ਗਿਆ ਹੈ। ਕੋਰਸ ਦਾ ਇੱਕ ਭਾਗ ਛੂਤ ਦੀਆਂ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਵਿੱਚ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਵਿਸ਼ਿਆਂ ਲਈ ਸਮਰਪਿਤ ਹੈ। ਹਦਾਇਤਾਂ ਦੇ ਪ੍ਰਾਇਮਰੀ ਤਰੀਕਿਆਂ ਵਿੱਚ ਲੈਕਚਰ, ਕੇਸ-ਅਧਾਰਿਤ ਚਰਚਾ/ਪ੍ਰਸਤੁਤੀ, ਮਰੀਜ਼-ਅਧਾਰਿਤ ਸਮੱਸਿਆ-ਹੱਲ ਕਰਨ ਦੇ ਅਭਿਆਸ, ਕਲੀਨਿਕਲ ਸਬੰਧ ਅਤੇ ਪ੍ਰਯੋਗਸ਼ਾਲਾ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ਮੁਲਾਂਕਣ ਦੇ ਢੰਗਾਂ ਵਿੱਚ ਵਿਭਾਗੀ ਲਿਖਤੀ ਬਹੁ-ਚੋਣ ਪ੍ਰੀਖਿਆ ਅਤੇ ਸਮੱਸਿਆ-ਹੱਲ ਕਰਨ ਦੇ ਅਭਿਆਸਾਂ ਵਿੱਚ ਭਾਗੀਦਾਰੀ ਦਾ ਮੁਲਾਂਕਣ, ਕੇਸ ਅਧਿਐਨ ਚਰਚਾਵਾਂ ਅਤੇ ਕੰਪਿਊਟਰ ਸਿਮੂਲੇਟਡ ਪ੍ਰਯੋਗਸ਼ਾਲਾ ਅਭਿਆਸ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ।

ਇੱਕ ਦੋ-ਸਮੇਸਟਰ, ਸੱਤ-ਕ੍ਰੈਡਿਟ-ਘੰਟੇ (PAMB 641 - ਡਿੱਗਣ) ਅਤੇ ਛੇ-ਕ੍ਰੈਡਿਟ-ਘੰਟੇ (PAMB 642 - ਬਸੰਤ), ਦੂਜੇ ਸਾਲ ਦਾ ਕੋਰਸ ਜੋ ਵਿਦਿਆਰਥੀਆਂ ਨੂੰ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਦੇ ਬੁਨਿਆਦੀ ਤੰਤਰ ਦੀ ਸਮਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਸਰੀਰ ਦੀ ਪ੍ਰਤੀਕਿਰਿਆ ਇਹ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਅਤੇ ਮਰੀਜ਼ ਦੇ ਲੱਛਣਾਂ, ਲੱਛਣਾਂ ਅਤੇ ਖਾਸ ਅੰਗ ਪ੍ਰਣਾਲੀਆਂ ਵਿੱਚ ਟੈਸਟਾਂ ਵਿੱਚ ਇਹਨਾਂ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਦਾ ਪ੍ਰਗਟਾਵਾ। ਸਿੱਖਿਆ ਦੇ ਪ੍ਰਾਇਮਰੀ ਤਰੀਕਿਆਂ ਵਿੱਚ ਲੈਕਚਰ ਅਤੇ ਛੋਟੀ-ਸਮੂਹ ਚਰਚਾ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ। ਮੁਲਾਂਕਣ ਦੇ ਢੰਗਾਂ ਵਿੱਚ ਇੱਕ NBME ਵਿਸ਼ੇ ਦੀ ਪ੍ਰੀਖਿਆ ਅਤੇ ਵਿਭਾਗੀ ਬਹੁ-ਚੋਣ ਪ੍ਰੀਖਿਆਵਾਂ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ।

ਇਹ ਗ੍ਰੈਜੂਏਟ ਪੱਧਰ ਦਾ ਕੋਰਸ ਇਮਿਊਨ ਸਿਸਟਮ ਦੇ ਭਾਗਾਂ ਨੂੰ ਕਵਰ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਪੈਦਾਇਸ਼ੀ ਅਤੇ ਅਨੁਕੂਲ ਇਮਿਊਨ ਸਿਸਟਮ, ਉਹਨਾਂ ਦੇ ਕਾਰਜ ਅਤੇ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ਰੋਗ ਅਤੇ ਸਿਹਤ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਇਮਿਊਨ ਸਿਸਟਮ ਦੇ ਵਿਗਾੜ ਅਤੇ ਨਤੀਜਿਆਂ ਬਾਰੇ ਵਿਸ਼ੇ ਸ਼ਾਮਲ ਕੀਤੇ ਗਏ ਹਨ। ਇਮਯੂਨੋਲੋਜੀ ਵਿੱਚ ਦਿਲਚਸਪੀ ਦੇ ਮੌਜੂਦਾ ਵਿਸ਼ਿਆਂ ਨੂੰ ਵੀ ਕਵਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ। ਕੁੱਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਵਿਦਿਆਰਥੀ ਇਮਿਊਨ ਸਿਸਟਮ ਦੀ ਉੱਨਤ ਸਮਝ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਨਗੇ।

ਇਸ ਕੋਰਸ ਦੇ ਅੰਤ ਤੱਕ ਵਿਦਿਆਰਥੀ ਇਸ ਵਿੱਚ ਗਿਆਨ ਅਤੇ ਸਮਝ ਦਾ ਪ੍ਰਦਰਸ਼ਨ ਕਰੇਗਾ:

  1. ਇਮਿਊਨ ਸਿਸਟਮ ਦੇ ਹਿੱਸੇ ਅਤੇ ਉਹਨਾਂ ਦੇ ਕਾਰਜ।
  2. ਇਮਿਊਨ ਸਿਸਟਮ ਦੇ ਹਿੱਸੇ ਵਿਚਕਾਰ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ.
  3. ਇਮਿਊਨ ਸਿਸਟਮ ਡਿਸਆਰਗੂਲੇਸ਼ਨ ਅਤੇ ਨਤੀਜੇ.
  4. ਸਿਹਤ ਅਤੇ ਬਿਮਾਰੀ ਦੇ ਦੌਰਾਨ ਪ੍ਰਤੀਰੋਧੀ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆ.

ਇਸ ਕੋਰਸ ਵਿੱਚ, ਵਿਦਿਆਰਥੀ ਹੇਠਾਂ ਦਿੱਤੇ ਵਿਸ਼ਿਆਂ ਨੂੰ ਸਿੱਖਦੇ ਅਤੇ ਸਮਝਦੇ ਹਨ:

  • ਅਪੋਪਟੋਸਿਸ ਅਤੇ ਨਿਊਰੋਡੀਜਨਰੇਟਿਵ ਅਤੇ ਘਾਤਕ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਵਿੱਚ ਇਸਦੇ ਪ੍ਰਭਾਵ
  • ਬਾਇਓਮੈਡੀਕਲ ਵਿਗਿਆਨ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਿਕਸ
  • ਸਟੈਮ ਸੈੱਲਾਂ ਦੀਆਂ ਬੁਨਿਆਦੀ ਧਾਰਨਾਵਾਂ ਅਤੇ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਵਿੱਚ ਉਹਨਾਂ ਦੀਆਂ ਭੂਮਿਕਾਵਾਂ
  • ਵੱਖ-ਵੱਖ ਰੋਗ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਵਿੱਚ ਸੈੱਲ ਸਿਗਨਲ ਵਿੱਚ ਜੀ-ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਭੂਮਿਕਾ
  • ਬੁਨਿਆਦੀ ਅਤੇ ਕਲੀਨਿਕਲ ਐਪਲੀਕੇਸ਼ਨਾਂ ਲਈ ਜੀਨ ਥੈਰੇਪੀ ਪਹੁੰਚ ਅਤੇ ਜੀਨ ਥੈਰੇਪੀ ਅਧਾਰਤ ਇਲਾਜ ਵਿਗਿਆਨ ਦਾ ਵਿਕਾਸ

ਇਸ ਕੋਰਸ ਦਾ ਸੰਚਾਲਨ ਕਰਨ ਲਈ ਘੱਟੋ-ਘੱਟ 4 ਵਿਦਿਆਰਥੀਆਂ ਦੀ ਲੋੜ ਹੁੰਦੀ ਹੈ।

ਇਸ ਕੋਰਸ ਵਿੱਚ, ਵਿਦਿਆਰਥੀ ਹੇਠਾਂ ਦਿੱਤੇ ਵਿਸ਼ਿਆਂ ਨੂੰ ਸਿੱਖਦੇ ਅਤੇ ਸਮਝਦੇ ਹਨ:

  • ਵੱਖ-ਵੱਖ ਨਿਓਪਲਾਸਟਿਕ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਅਤੇ ਨਿਓਪਲਾਸੀਆ ਦੇ ਆਮ ਰੋਗ ਵਿਗਿਆਨ ਦੇ ਬੁਨਿਆਦੀ ਹਿੱਸੇ
  • ਮੈਟਾਸਟੇਸਿਸ, ਓਨਕੋਜੀਨਸ, ਟਿਊਮਰ ਨੂੰ ਦਬਾਉਣ ਵਾਲੇ ਜੀਨਾਂ ਅਤੇ ਟੈਲੋਮੇਰੇਜ਼ ਦੀ ਵਿਧੀ
  • ਏਡਜ਼ ਨਾਲ ਸਬੰਧਤ ਖਤਰਨਾਕ ਬਿਮਾਰੀਆਂ
  • ਕੈਂਸਰ ਵਿੱਚ ਸੰਕੇਤ ਮਾਰਗ
  • ਡੀਐਨਏ ਅਤੇ ਆਰਐਨਏ ਟਿਊਮਰ ਵਾਇਰਸ ਐਪੋਪਟੋਸਿਸ ਅਤੇ ਕੈਂਸਰ
  • ਸਟੈਮ ਸੈੱਲ ਅਤੇ ਕੈਂਸਰ
  • ਐਚਪੀਵੀ ਟੀਕੇ ਕੈਂਸਰ ਮਹਾਂਮਾਰੀ ਵਿਗਿਆਨ ਅਤੇ ਕੀਮੋਪ੍ਰੀਵੇਂਸ਼ਨ
  • ਵਾਤਾਵਰਨ ਕਾਰਸੀਨੋਜੇਨੇਸਿਸ
  • ਕੈਂਸਰ ਖੋਜ ਅਤੇ ਕੈਂਸਰ ਕੀਮੋਥੈਰੇਪੀ ਵਿੱਚ ਜਾਨਵਰਾਂ ਦੇ ਮਾਡਲ

ਇਸ ਕੋਰਸ ਦਾ ਸੰਚਾਲਨ ਕਰਨ ਲਈ ਘੱਟੋ-ਘੱਟ 4 ਵਿਦਿਆਰਥੀਆਂ ਦੀ ਲੋੜ ਹੁੰਦੀ ਹੈ।

ਇਹ ਕੋਰਸ ਪਤਝੜ ਅਤੇ ਬਸੰਤ ਸਮੈਸਟਰਾਂ ਵਿੱਚ ਪੇਸ਼ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਮੁੱਖ ਤੌਰ 'ਤੇ ਉਨ੍ਹਾਂ ਗ੍ਰੈਜੂਏਟ ਵਿਦਿਆਰਥੀਆਂ ਨੂੰ ਜਿਨ੍ਹਾਂ ਦੀ ਮੁੱਢਲੀ ਇਮਯੂਨੋਲੋਜੀ ਵਿੱਚ ਪਿਛੋਕੜ ਹੈ। ਕੋਰਸ ਦਾ ਫਾਰਮੈਟ ਇੱਕ ਜਰਨਲ ਕਲੱਬ ਦੇ ਰੂਪ ਵਿੱਚ ਹੈ ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਵਿਗਿਆਨ, ਕੁਦਰਤ, ਕੁਦਰਤ ਦੀ ਦਵਾਈ, ਕੁਦਰਤ ਇਮਯੂਨੋਲੋਜੀ, ਨੈਸ਼ਨਲ ਅਕੈਡਮੀ ਦੀਆਂ ਕਾਰਵਾਈਆਂ ਵਰਗੇ ਉੱਚ-ਪ੍ਰਭਾਵੀ ਰਸਾਲਿਆਂ ਵਿੱਚ ਛਪੇ ਮੌਜੂਦਾ ਇਮਯੂਨੋਲੋਜੀ ਸਾਹਿਤ ਉੱਤੇ ਹਫਤਾਵਾਰੀ ਆਧਾਰ 'ਤੇ 2-3 ਪੇਪਰਾਂ 'ਤੇ ਚਰਚਾ ਕੀਤੀ ਜਾਵੇਗੀ। ਸਾਇੰਸਜ਼, ਯੂ.ਐਸ.ਏ., ਜਰਨਲ ਆਫ਼ ਐਕਸਪੈਰੀਮੈਂਟਲ ਮੈਡੀਸਨ, ਜਰਨਲ ਆਫ਼ ਇਮਯੂਨੋਲੋਜੀ, ਸੈੱਲ ਅਤੇ ਇਮਿਊਨਿਟੀ।

ਵਿਗਿਆਨਕ ਪੇਪਰ ਚਰਚਾ ਵਿੱਚ ਜਾਣ-ਪਛਾਣ, ਸਮੱਗਰੀ ਅਤੇ ਢੰਗ, ਨਤੀਜੇ, ਚਰਚਾ ਅਤੇ ਬਿਬਲਿਓਗ੍ਰਾਫੀ ਸ਼ਾਮਲ ਹੋਵੇਗੀ। ਇਸ ਕੋਰਸ ਦੇ ਸਭ ਤੋਂ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਪਹਿਲੂਆਂ ਵਿੱਚੋਂ ਇੱਕ ਹੈ ਵਿਦਿਆਰਥੀ ਨੂੰ ਆਲੋਚਨਾਤਮਕ ਖੋਜ ਦੀ ਸਿਖਲਾਈ ਦੇਣਾ ਅਤੇ ਨਾਵਲ ਸੰਕਲਪਾਂ ਅਤੇ ਤਕਨੀਕਾਂ ਨੂੰ ਸ਼ਾਮਲ ਕਰਕੇ ਆਪਣੀ ਖੋਜ ਦੀ ਗੁਣਵੱਤਾ ਵਿੱਚ ਸੁਧਾਰ ਕਰਨਾ।

ਇਹ ਕੋਰਸ ਗ੍ਰੈਜੂਏਟ ਵਿਦਿਆਰਥੀਆਂ ਨੂੰ ਮਨੁੱਖੀ ਰੋਗ ਵਿਗਿਆਨ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਬੁਨਿਆਦੀ ਬਾਇਓਮੈਡੀਕਲ ਗਿਆਨ ਅਧਾਰ ਅਤੇ ਬਿਮਾਰੀ ਦੀ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ ਦੇ ਅਧਿਐਨ ਲਈ ਇੱਕ ਜਾਣ-ਪਛਾਣ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਨ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ। ਮੁੱਖ ਮਨੁੱਖੀ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਅਤੇ ਸਥਿਤੀਆਂ ਦੀ ਪ੍ਰਗਤੀ ਅਤੇ ਨਤੀਜਿਆਂ ਦੇ ਦੌਰਾਨ ਹੋਣ ਵਾਲੇ ਕੁੱਲ ਅਤੇ ਸੂਖਮ ਪੈਥੋਲੋਜੀਕਲ ਪੈਟਰਨਾਂ ਦੇ ਐਟਿਓਲੋਜੀ, ਪੈਥੋਜੇਨੇਸਿਸ ਅਤੇ ਵਰਣਨ 'ਤੇ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਜ਼ੋਰ ਦਿੱਤਾ ਜਾਵੇਗਾ।

ਵਿਦਿਆਰਥੀਆਂ ਨੂੰ ਸੰਬੰਧਿਤ ਰੋਗ ਵਿਗਿਆਨਾਂ ਦੀ ਨਕਲ ਕਰਨ ਵਾਲੇ ਜਾਨਵਰਾਂ ਦੇ ਮਾਡਲਾਂ ਦੇ ਵਰਣਨ ਦੁਆਰਾ, ਵਿਕਾਸ ਦੇ ਪ੍ਰਯੋਗਾਤਮਕ ਪਹੁੰਚ ਅਤੇ ਬਾਅਦ ਵਿੱਚ ਕੁਝ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਦੇ ਪ੍ਰਭਾਵੀ ਇਲਾਜ ਨਾਲ ਜਾਣੂ ਕਰਵਾਇਆ ਜਾਵੇਗਾ। ਸਧਾਰਣ ਹਿਸਟੋਲੋਜੀ ਦੇ ਗਿਆਨ ਦੇ ਨਾਲ, ਅਤੇ ਪ੍ਰਯੋਗਸ਼ਾਲਾ ਦੇ ਛੋਟੇ ਸਮੂਹਾਂ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਹੱਥ-ਨਾਲ ਅਨੁਭਵ ਦੁਆਰਾ ਸੂਖਮ ਦਿੱਖਾਂ ਦੀ ਜਾਣ-ਪਛਾਣ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਕੇ, ਵਿਦਿਆਰਥੀ ਨਿਰੀਖਣ ਅਤੇ ਵਰਣਨ ਯੋਗ ਹੁਨਰ ਵਿਕਸਿਤ ਕਰਨਗੇ ਅਤੇ ਅੰਤ ਵਿੱਚ ਬਿਮਾਰੀ ਦੇ ਅੰਤਰੀਵ ਤੰਤਰ ਦੀ ਆਪਣੀ ਸਮਝ ਨੂੰ ਡੂੰਘਾ ਕਰਨਗੇ। ਪ੍ਰਯੋਗਾਤਮਕ ਵਿਧੀਆਂ ਦੇ ਵਰਣਨ ਦੁਆਰਾ, ਵੱਖ-ਵੱਖ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਦੇ ਮੂਰੀਨ ਮਾਡਲਾਂ ਸਮੇਤ, ਉਹ ਬਿਮਾਰੀ ਦੇ ਅਧਿਐਨ ਵਿੱਚ ਕਾਰਕ ਪਹੁੰਚ ਨੂੰ ਤਿਆਰ ਕਰਨਗੇ।

ਖੋਜ ਖੇਤਰ ਫੋਕਸ ਗਰੁੱਪ

ਸਾਡੇ ਫੈਕਲਟੀ ਦੇ ਖੋਜ ਹਿੱਤ ਹੇਠਾਂ ਦਿੱਤੇ ਮੁੱਖ ਥੀਮੈਟਿਕ ਸਮੂਹਾਂ ਦੇ ਅਧੀਨ ਆਉਂਦੇ ਹਨ।

ਸਾਰੇ ਭੜਕਾਊ ਅਤੇ ਆਟੋਇਮਿਊਨ ਰੋਗਾਂ ਦਾ ਵਿਸਥਾਰ ਕਰੋ

    - ਮਲਟੀਪਲ ਸਕਲੇਰੋਸਿਸ ਅਤੇ ਆਟੋਇਮਿਊਨ ਹੈਪੇਟਾਈਟਸ ਸਮੇਤ ਸੋਜ਼ਸ਼ ਅਤੇ ਆਟੋਇਮਿਊਨ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਦਾ ਐਪੀਜੇਨੇਟਿਕ ਨਿਯਮ। - ਕੋਲਾਈਟਿਸ, ਮੋਟਾਪਾ ਅਤੇ ਕੈਂਸਰ ਵਰਗੀਆਂ ਭੜਕਾਊ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਵਿੱਚ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ ਦਾ ਪ੍ਰਭਾਵ। - ਕੋਲਨ ਕੈਂਸਰ ਵਿੱਚ ਮੈਕਰੋਫੇਜ-ਪ੍ਰੇਰਿਤ ਸੋਜਸ਼ ਦੀ ਭੂਮਿਕਾ। - ਐਟੌਪਿਕ ਡਰਮੇਟਾਇਟਸ ਵਿੱਚ ਚਮੜੀ ਦੀ ਸੋਜਸ਼ ਨੂੰ ਨਿਸ਼ਾਨਾ ਬਣਾਉਣਾ। - ਹੋਸਟ-ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ ਡਾਇਸਬਾਇਓਸਿਸ ਦੇ ਕਾਰਨ ਪ੍ਰਾਇਮਰੀ ਐਂਟੀਬਾਡੀ ਦੀ ਘਾਟ ਅਤੇ ਸੋਜਸ਼ ਦਾ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ। - ਲੂਪਸ, ਐਮਐਸ ਅਤੇ ਡਾਇਬੀਟੀਜ਼ ਵਿੱਚ ਐਰੀਲ ਹਾਈਡਰੋਕਾਰਬਨ ਰੀਸੈਪਟਰ ਦੀ ਭੂਮਿਕਾ। - ਕੋਲਾਈਟਿਸ ਅਤੇ ਕੋਲਨ ਕੈਂਸਰ ਦੇ ਪੂਰਵ-ਕਲੀਨੀਕਲ ਮਾਡਲਾਂ ਵਿੱਚ ਮੈਕਰੋਫੇਜ ਦੁਆਰਾ ਪੈਦਾ ਕੀਤੇ ਟਿਊਮਰ ਨੈਕਰੋਸਿਸ ਫੈਕਟਰ ਅਲਫ਼ਾ ਦੀ ਸ਼ਮੂਲੀਅਤ।
    - ਮੋਟਾਪੇ ਅਤੇ ਪਾਚਕ ਵਿਕਾਰ ਵਿੱਚ ਕਸਰਤ ਦਾ ਪ੍ਰਭਾਵ। - ਮੋਟਾਪੇ ਅਤੇ ਮੈਟਾਬੋਲਿਕ ਸਿੰਡਰੋਮ ਨੂੰ ਸ਼ਾਮਲ ਕਰਨ ਵਿੱਚ ਸੈਲੂਲਰ ਅਤੇ ਅਣੂ ਵਿਧੀ। - ਮੋਟਾਪੇ ਦੇ ਇਲਾਜ ਵਿੱਚ ਕੈਨਾਬਿਨੋਇਡ ਰੀਸੈਪਟਰ ਵਿਰੋਧੀ. - ਮੋਟਾਪੇ ਵਿੱਚ ਅੰਤੜੀਆਂ ਦਾ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ। - ਮਾਸਪੇਸ਼ੀ ਦੀ ਬਰਬਾਦੀ ਦੇ ਵਿਕਾਰ ਵਿੱਚ ਕਸਰਤ ਅਤੇ ਮੋਟਾਪੇ ਦੀ ਭੂਮਿਕਾ.
    - ਗਲਾਈਓਬਲਾਸਟੋਮਾ ਅਤੇ ਨਿਊਰੋਬਲਾਸਟੋਮਾ ਦੇ ਇਲਾਜ ਵਿੱਚ ਕੀਮੋਇਮੂਨੋਥੈਰੇਪੀ ਦੀ ਵਰਤੋਂ। - ਕੈਂਸਰ ਥੈਰੇਪੀ ਲਈ ਮੈਕਰੋਫੈਜ ਅਤੇ ਮਾਸਟ ਸੈੱਲਾਂ ਵਿੱਚ ਸਪਿੰਗੋਸਾਈਨ -1 ਫਾਸਫੇਟ ਨੂੰ ਨਿਸ਼ਾਨਾ ਬਣਾਉਣਾ। - ਨਿਊਰੋਬਲਾਸਟੋਮਾ ਅਤੇ ਮੇਲਾਨੋਮਾ ਤੋਂ ਟਿਊਮਰ ਸਟੈਮ ਸੈੱਲਾਂ ਵਿੱਚ ਐਪੋਪਟੋਸਿਸ ਨੂੰ ਸ਼ਾਮਲ ਕਰਨ ਵਿੱਚ ਮਾਈਕ੍ਰੋਆਰਐਨਏ ਦੀ ਭੂਮਿਕਾ। - ਪੌਦਿਆਂ ਦੇ ਉਤਪਾਦਾਂ ਦੁਆਰਾ ਐਪੀਜੀਨੇਟਿਕ ਰੈਗੂਲੇਸ਼ਨ ਕੋਲਨ ਕੈਂਸਰ। - ਕੈਰੀਨੋਜੇਨੇਸਿਸ ਅਧੀਨ ਅਣੂ ਵਿਧੀ। - ਐਚ. ਪਾਈਲੋਰੀ ਪ੍ਰੇਰਿਤ ਕਾਰਸੀਨੋਜੇਨੇਸਿਸ। - ਕੋਲੋਰੇਕਟਲ ਕੈਂਸਰ ਵਿੱਚ ਸੁਭਾਵਕ ਦਰਦ ਦੀ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ।
    - ਮਲਟੀਪਲ ਸਕਲੇਰੋਸਿਸ, ਕੋਲਾਈਟਿਸ ਅਤੇ ਮੋਟਾਪੇ ਦੇ ਇਲਾਜ ਵਿੱਚ ਪੌਦਿਆਂ ਦੇ ਉਤਪਾਦਾਂ (ਰੇਸਵੇਰਾਟ੍ਰੋਲ ਅਤੇ ਕੈਨਾਬਿਨੋਇਡਜ਼) ਦੇ ਪ੍ਰਭਾਵਾਂ ਬਾਰੇ ਐਪੀਜੀਨੋਮਿਕ ਅਧਿਐਨ। - ਕੋਲਾਈਟਿਸ, ਫੇਫੜਿਆਂ ਦੀ ਗੰਭੀਰ ਸੱਟ, ਐਮਐਸ ਅਤੇ ਮੋਟਾਪੇ ਵਿੱਚ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ ਨੂੰ ਨਿਯਮਤ ਕਰਨ 'ਤੇ ਖੁਰਾਕ ਪੂਰਕਾਂ (ਇੰਡੋਲਜ਼, ਆਦਿ) ਦੇ ਪ੍ਰਭਾਵ। - ਛਾਤੀ ਅਤੇ ਕੋਲਨ ਕੈਂਸਰ ਦੇ ਨਾਲ-ਨਾਲ ਮੋਟਾਪੇ ਨਾਲ ਚੱਲਣ ਵਾਲੇ ਕੈਂਸਰ ਦੀ ਤਰੱਕੀ ਵਿੱਚ ਕਸਰਤ ਅਤੇ ਖੁਰਾਕ ਉਤਪਾਦਾਂ (ਕਰਕੁਮਿਨ, ਕਵੇਰਸਟਿਨ ਅਤੇ ਇਮੋਡਿਨ) ਦੀ ਭੂਮਿਕਾ। - ਐਮਐਸ, ਲੂਪਸ ਅਤੇ ਡਾਇਬੀਟੀਜ਼ 'ਤੇ ਰੇਸਵੇਰਾਟ੍ਰੋਲ ਅਤੇ ਹੋਰ ਏਐਚਆਰ ਲਿਗੈਂਡਸ ਦੀ ਉਪਚਾਰਕ ਪ੍ਰਭਾਵਸ਼ੀਲਤਾ। - ਮਾਸਪੇਸ਼ੀ ਦੀ ਬਰਬਾਦੀ ਦੇ ਵਿਕਾਰ ਦਾ ਇਲਾਜ ਕਰਨ ਲਈ ਖੁਰਾਕ ਕੁਆਰੇਸੀਟਿਨ ਦਾ ਵਿਕਾਸ। ਕੈਂਸਰ-ਪ੍ਰੇਰਿਤ ਵਿਸਰਲ ਦਰਦ ਵਿੱਚ ਨਿਊਰੋ-ਇਮਿਊਨ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ 'ਤੇ ਓਜੀਓਕ-ਸੈਨ ਦੇ ਪ੍ਰਭਾਵ.


ਸਮੱਗਰੀ ਅਤੇ ਢੰਗ

ਜਦੋਂ ਤੱਕ ਹੋਰ ਨਹੀਂ ਕਿਹਾ ਜਾਂਦਾ, ਸਾਰੀਆਂ ਵਪਾਰਕ ਕਿੱਟਾਂ ਨਿਰਮਾਤਾ ਦੀਆਂ ਹਦਾਇਤਾਂ ਅਨੁਸਾਰ ਵਰਤੀਆਂ ਜਾਂਦੀਆਂ ਸਨ।

ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਲ ਤਣਾਅ ਅਤੇ ਵਿਕਾਸ ਦੀਆਂ ਸਥਿਤੀਆਂ

ਇਸ ਅਧਿਐਨ ਵਿੱਚ ਵਰਤੇ ਗਏ ਸਾਰੇ ਤਣਾਅ ਅਤੇ ਪਲਾਜ਼ਮੀਡ ਕ੍ਰਮਵਾਰ ਟੇਬਲ S2 ਅਤੇ S3 ਵਿੱਚ ਸੂਚੀਬੱਧ ਅਤੇ ਵਰਣਨ ਕੀਤੇ ਗਏ ਹਨ। M. ਮਾਈਕੋਇਡਜ਼ subsp ਕੈਪਰੀ SP5 ਮੀਡੀਆ (39), ਬਿਨਾਂ ਅੰਦੋਲਨ ਦੇ ਢੁਕਵੇਂ ਐਂਟੀਬਾਇਓਟਿਕਸ [ਟੈਟਰਾਸਾਈਕਲਿਨ (5 ਜਾਂ 10 μg/ml)] ਨਾਲ ਪੂਰਕ। ਸੈਲੂਲੋ ਐਂਟੀਬਾਡੀ ਕਲੀਵੇਜ ਅਤੇ ਇਮਿਊਨ ਸੇਰਾ ਐਗਗਲੂਟੀਨੇਸ਼ਨ ਪ੍ਰਯੋਗਾਂ ਲਈ, ਐਮ.ਐਮ.ਸੀ SP5 ਮੀਡੀਆ ਵਿੱਚ ਤਣਾਅ ਪੈਦਾ ਕੀਤੇ ਗਏ ਸਨ, ਭਰੂਣ ਬੋਵਾਈਨ ਸੀਰਮ ਦੀ ਕਮੀ [ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ 17% (v/v) ਤੇ ਵਰਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ ਅਤੇ ਲਾਗ ਵਾਲੇ ਜਾਨਵਰਾਂ ਤੋਂ ਲਏ ਗਏ 4% v/v ਬੱਕਰੀ ਸੀਰਮ ਨਾਲ ਪੂਰਕ]।

ਮਾਈਕੋਪਲਾਜ਼ਮਾ ਕੈਪਰੀਕੋਲਮ subsp capricolum ਟਰਾਂਸਪਲਾਂਟੇਸ਼ਨ ਲਈ ਵਰਤੀ ਜਾਂਦੀ ਸੀਕੇ ΔRE ਨੂੰ ਬਿਨਾਂ ਅੰਦੋਲਨ ਦੇ SOB (ਸੁਪਰ ਅਨੁਕੂਲ ਬਰੋਥ) ਮੀਡੀਆ ਵਿੱਚ 37°C 'ਤੇ ਉਗਾਇਆ ਗਿਆ ਸੀ (40). ਈ. ਕੋਲੀ ਪਲਾਜ਼ਮੀਡ ਕਲੋਨਿੰਗ, ਰੱਖ-ਰਖਾਅ, ਅਤੇ ਪ੍ਰਸਾਰ ਲਈ ਵਰਤੇ ਜਾਣ ਵਾਲੇ ਤਣਾਅ LB ਮੀਡੀਆ ਵਿੱਚ ਨਿਯਮਤ ਤੌਰ 'ਤੇ 37°C 'ਤੇ ਉਗਾਇਆ ਗਿਆ ਸੀ, ਜੋ ਕਿ ਢੁਕਵੇਂ ਐਂਟੀਬਾਇਓਟਿਕਸ [ਐਂਪਿਸਿਲਿਨ (100 μg/ml), ਕੈਨਾਮਾਈਸਿਨ (50 μg/ml), ਅਤੇ ਟੈਟਰਾਸਾਈਕਲਿਨ (10 μg/ml) ਨਾਲ ਪੂਰਕ ਸਨ। )] ਅਤੇ 0.5% (m/vol) ਗਲੂਕੋਜ਼। ਮੁੜ ਸੰਜੋਗ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਲਈ, ਈ. ਕੋਲੀ ਸਟੱਡੀਅਰਜ਼ ਆਟੋਇੰਡਕਸ਼ਨ ਮੀਡੀਆ ZYP5052 (41) ਉਚਿਤ ਐਂਟੀਬਾਇਓਟਿਕਸ [ਕੈਨਾਮਾਈਸਿਨ (100 μg/ml) ਅਤੇ ਕਲੋਰਾਮਫੇਨਿਕੋਲ (34 μg/ml)] ਨਾਲ ਪੂਰਕ। ਸਾਰੇ ਤਰਲ ਸਭਿਆਚਾਰ ਅੰਦੋਲਨ (180 ਤੋਂ 220 rpm) ਦੇ ਅਧੀਨ ਕੀਤੇ ਗਏ ਸਨ।

ਸੈਕੈਰੋਮਾਈਸਿਸ ਸੇਰੇਵਿਸੀਆ strains were routinely grown at 30°C in YPD (yeast extract, peptone, and dextrose) media or SD (Synthetic Defined) media supplemented with the appropriate dropout solution (-His, -His-Trp, and -His-Ura-Trp). All liquid cultures were performed under agitation (180 to 220 rpm).

ਅਣੂ ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ

All the oligonucleotides used in this study were provided by a commercial supplier (Eurogentec) and are listed in table S4. Unless stated otherwise, all polymerase chain reactions (PCRs) to amplify DNA cassettes used for cloning or genome editing were performed using the Q5 polymerase (NEB) all PCRs to screen yeast clones and mycoplasma clones were performed using the Advantage2 polymerase mix (Clontech) all PCRs for colony PCR were performed using the Taq polymerase (NEB).

Plasmids for the expression of recombinant MIBs and MIPs in E. coli. The cloning strategy used here is identical to that previously reported to express and produce MIB83 and MIP82 (12). The amino acid sequences of the proteins encoded by the loci MMCAP2_0589–0584 were extracted from the MolliGen 3.0 database (https://services.cbib.u-bordeaux.fr/molligen/) (42), codon-optimized for expression in ਈ. ਕੋਲੀ using the web-based tool JCat (http://www.jcat.de) (43) with the default parameters for ਈ. ਕੋਲੀ, and chemically synthesized (Twist Bioscience). The coding sequences, truncated to remove the predicted N-terminal transmembrane domains, were amplified by PCR using the Q5 DNA polymerase (NEB) and cloned in the pET28a(+) vector (Merck) using the In-Fusion Cloning kit (Clontech). The inserts were cloned in-frame with an N-terminal 6-His tag and a thrombin cleavage site. The vectors were then transformed by heat shock in chemically competent ਈ. ਕੋਲੀ NEB5-alpha. The transformed bacteria were plated on solid LB media and selected for kanamycin resistance. Individual colonies were screened by colony PCR and the plasmids were isolated from positive clones using the NucleoSpin Plasmid kit (Macherey Nagel) and checked by sequencing.

Plasmids for the expression of guide RNA in S. cerevisiae. Target sequences for the Cas9 nuclease were selected by using the “CRISPR Guides” tool available in the Benchling work environment (https://benchling.com). The raw nucleotide sequence of the Mmc genome was used as input. The software parameters were “Design Type: Single Guide,” “Guide Length: 20,” “Genome: R64–1-1 (sacCer3),” and “PAM: NGG.” All other parameters were set to default. Target sequences in the desired region with the highest on-target score and the lowest off-target score were selected. The corresponding plasmids were produced by modifying the protospacer sequence of the plasmid p426-SNR52p-gRNA.Y-SUP4t, using the Q5 Site Directed Mutagenesis kit (NEB). After the cloning reactions, the plasmids were transformed by heat shock in chemically competent ਈ. ਕੋਲੀ NEB5-alpha (NEB). The transformed bacteria were plated on solid LB media and selected for ampicillin resistance. Individual colonies were subsequently cultivated and used for plasmid isolation using the NucleoSpin Plasmid kit (Macherey Nagel). Plasmids were sequenced to verify the absence of errors.

In-yeast recombination templates. Linear DNA fragments used as recombination templates in yeast are composed of two sequences homologous to the regions flanking the bacterial genome locus to edit. ਦਾ ਨਿਰਮਾਣ ਕਰਨ ਲਈ Mmc ΔMIB-MIP mutant strain, these sequences were 45-bp long each. The corresponding 90-bp fragments were produced by annealing two complementary 90-base oligonucleotides. To do so, both oligonucleotides were mixed in equimolar amounts in CutSmart buffer (NEB), denatured by heating to 95°C and annealed by gradually cooling to 16°C at the rate of 0.1°/s in a thermocycler. ਦਾ ਨਿਰਮਾਣ ਕਰਨ ਲਈ Mmc MIB83-MIP82 ਅਤੇ Mmc MIP82-HA mutant strains, the DNA cassette contained two 500-bp sequences. Each of the 500-bp fragment was amplified by PCR using Mmc GM12 genomic DNA as template. The amplicons were purified using the Illustra GFX kit (GE), mixed in equimolar amounts and stitched together by overlapping PCR. The resulting 1000-bp amplicon was purified and 5′ A-tailed using the Taq polymerase (NEB). The resulting fragment was A-T cloned in the pGEMT-easy vector. After the molecular cloning reaction, the plasmids were transformed by heat shock in chemically competent ਈ. ਕੋਲੀ NEB5-alpha. The transformed bacteria were plated on solid LB media and selected for ampicillin resistance. Individual colonies were subsequently cultivated and used for plasmid isolation using the NucleoSpin Plasmid kit (Macherey Nagel). Plasmids were sequenced to verify the absence of errors. Last, the desired 1000-bp fragment was a PCR-amplified clone using the Q5 DNA polymerase (NEB) and purified using the Illustra GFX kit (GE).

ਦੀ ਪੀੜ੍ਹੀ Mmc mutant strains

Editing of Mmc chromosome cloned in yeast. ਦੇ ਪਰਿਵਰਤਨਸ਼ੀਲ ਤਣਾਅ Mmc GM12 were generated using the “in-yeast genome edition and back transplantation” method (44). This technique relies on our ability to clone a bacterial chromosome in ਐੱਸ. ਸੇਰੇਵਿਸੀਆ and edit it using tools available in this yeast. The edited bacterial genome can then be extracted and transplanted in a recipient cell, where it will drive the emergence of a new mutant bacterial strain.

The chromosome of Mmc GM12 was previously cloned in the yeast ਐੱਸ. ਸੇਰੇਵਿਸੀਆ W303 (45), through the integration in the bacterial genome of a yeast centromeric plasmid (YCp) between the loci MMCAP2_0016 and MMCAP2_0017. This YCp bears a yeast centromere and origin of replication, the His6 auxotrophic marker, and the TetM selection marker. The centromere and origin of replication drive the correct replication of the bacterial chromosome, while the His6 marker ensures its maintenance. This YCp-marked bacterial genome can be transplanted to generate the strain Mmc 1.1, which is resistant to tetracycline. ਐੱਸ. ਸੇਰੇਵਿਸੀਆ W303–Mmc 1.1 was used to generate all the Mmc mutant strains used in this study.

Editing of the Mmc 1.1 genome in yeast was carried out using the CRISPR-Cas9 system (44, 46). First, the yeast W303–Mmc 1.1 was transformed with 300 ng of the plasmid pCas9, using the lithium acetate method (47). This plasmid allows the constitutive expression of the ਸਟ੍ਰੈਪਟੋਕਾਕਸ ਪਾਈਓਜੀਨਸ Cas9 nuclease. Yeast transformants were selected and maintained on solid SD-His-Trp media. The yeast W303–Mmc 1.1–pCas9 was then transformed again, using the same lithium acetate protocol, with 300 ng of the appropriate plasmid pgRNA and 500 ng of the appropriate DNA recombination template. After transformation, the yeasts were maintained 48 hours in liquid SD-His-Trp-Ura media at 30°C under shaking and then plated on solid SD-His-Trp-Ura media. Individual yeast clones were screened to isolate the ones that carried the properly edited bacterial genome. To do so, three steps were performed.

First, yeast total DNA was extracted using the method described by Kouprina and Larionov (48) and used as a template for a PCR analysis with primers flanking the targeted locus. If an amplicon of correct size was generated, it was subsequently sequenced to confirm that the edited locus matched the expected design. Subsequently, the total yeast DNA extract was used as a template for a multiplex PCR analysis, using 10 pairs of primers targeting 10 loci of various sizes (ranging from 377 to 1010 bp) spread evenly on the bacterial genome. This multiplex PCR was used to rapidly assess the integrity of the bacterial genome, to screen out clones in which large genomic regions have been deleted. Last, the size of the bacterial chromosome carried in the yeast was checked using pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) to check for potential genomic rearrangements or deletions between two adjacent multiplex PCR loci. To do so, agarose plugs containing the bacterial genomes were prepared using the protocol described by Tsarmpopoulos ਅਤੇ ਬਾਕੀ. (44) and the CHEF Mammalian Genomic DNA Plug Kit (Bio-Rad). Briefly, each yeast clone was cultured in 100 ml of SD-His-Trp-Ura media. The cells were harvested by centrifugation, washed, and counted on a Malassez counting chamber. Cells (3 × 10 8 ) were then embedded in 100 μl of 1% low melt agarose and cast in a mold to form cuboid-shaped plugs. After hardening and removal from the molds, the plugs were incubated in a cell lysis solution containing detergents and Proteinase K (Bio-Rad). After a washing step [20 mM tris and 50 mM EDTA (pH 8)] to remove the lysed components, the plugs contained only DNA molecules. Before the PFGE, the yeast DNA has to be removed from the plugs. To do so, the plugs were incubated overnight with a cocktail of restriction enzymes [30 U of Fse I, Rsr II, and Asi SI (NEB)] that do not target the bacterial genome. After restriction, the yeast chromosome fragments were removed from the plugs by standard gel electrophoresis. Under these conditions, the large, circular bacterial chromosomes are not mobile and therefore stayed in the plugs. After washing, the plugs were incubated overnight with 30 U of Xho I (NEB) to generate three large DNA fragments. The size of these fragments was analyzed by PFGE and compared to that of the expected design (590, 269, and 226 kbp).

Genome transplantation and transplant screening. To generate mutant bacterial strains, the edited genomes carried in yeast were back-transplanted in the recipient cell Mcap ΔRE, as described by Lartigue ਅਤੇ ਬਾਕੀ. (45). Briefly, agarose plugs containing the bacterial chromosomes were digested by incubation with β-agarase. The resulting chromosomal DNA solution was transformed in Mcap ΔRE cells using a polyethylene glycol–based transformation method. The transformants were selected by plating on solid SP5 media, supplemented with tetracycline (5 μg/ml). After 5 days of incubation at 37°C, individual colonies were collected using a small core drill, inoculated in liquid SP5 media supplemented with tetracycline (5 μg/ml) and incubated 24 hours at 37°C. The resulting culture was used to inoculate at 1% (v/v) fresh SP5 media supplemented with tetracycline (5 μg/ml). This new culture was incubated 24 hours at 37°C. The same passaging process was repeated thrice. At the end of the third passage, a 200-μl sample of the culture was collected and used for transplant screening. The cells were harvested by centrifugation [6800 relative centrifugal force (rcf) for 10 min], suspended in tris-EDTA buffer, and lysed by heating at 95°C for 10 min. The DNA extracted in the resulting solution was used as template for PCR analysis using the same primer pairs as for the yeast transformant screening process (see above). Validated transplants were stored as cell suspensions in fetal bovine serum at −80°C.

ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਿਕਸ

Sample preparation and protein digestion. Mmc cells grown in SP5 media were harvested by centrifugation (6800 rcf for 10 min), washed in SP5 depleted of fetal bovine serum, and suspended in 1× Laemmli sample buffer with β-mercaptoethanol. After heat denaturation (95°C for 10 min), the samples were separated by SDS-PAGE on a 10% acrylamide gel. After colloidal Coomassie staining, each sample lane was cut into four equal bands and each band was subsequently cut again into 1-mm × 1-mm gel pieces. Gel pieces were destained in 25 mM ammonium bicarbonate and 50% acetonitrile, rinsed twice in ultrapure water, and shrunk in acetonitrile for 10 min. After acetonitrile removal, gel pieces were dried at room temperature, covered with the trypsin solution (10 ng/μl in 50 mM NH4ਐਚ.ਸੀ.ਓ3), rehydrated at 4°C for 10 min, and lastly incubated overnight at 37°C. Spots were then incubated for 15 min in 50 mM NH4ਐਚ.ਸੀ.ਓ3 at room temperature with rotary shaking. The supernatant was collected, and an H2O/acetonitrile/HCOOH (47.5:47.5:5) extraction solution was added onto gel slices for 15 min. The extraction step was repeated twice. Supernatants were pooled and dried in a vacuum centrifuge. Digests were lastly solubilized in 0.1% HCOOH.

nLC-MS/MS analysis. Peptide mixture was analyzed on an Ultimate 3000 nanoLC system (Dionex) coupled to an Electrospray Orbitrap Fusion Lumos Tribrid Mass Spectrometer (Thermo Fisher Scientific). Ten microliters of peptide digests was loaded onto a 300-μm (inner diameter) × 5-mm C18 PepMap trap column (LC Packings) at a flow rate of 10 μl/min. The peptides were eluted from the trap column onto an analytical 75-mm (inner diameter) × 50-cm C18 Pep-Map column (LC Packings) with a 4 to 40% linear gradient of solvent B in 45 min (solvent A was 0.1% formic acid and solvent B was 0.1% formic acid in 80% acetonitrile). The separation flow rate was set at 300 nl/min. The mass spectrometer was operated in positive ion mode at a 1.8-kV needle voltage. Data were acquired using Xcalibur 4.1 software in a data-dependent mode. Mass spectrometry (MS) scans [375 to 1500 mass/charge ratio (m/z)] were recorded at a resolution of ਆਰ = 120,000 (at m/z 200) and an AGC target of 4 × 10 5 ions collected within 50 ms. Dynamic exclusion was set to 60 s and top speed fragmentation in HCD mode was performed over a 3-s cycle. MS/MS scans with a target value of 3 × 10 3 ions were collected in orbitrap [with a resolution of ਆਰ = 30,000 (at m/z 200)] with a maximum fill time of 54 ms. In addition, only +2 to +7 charged ions were selected for fragmentation. Other settings were as follows: no sheath or auxiliary gas flow, heated capillary temperature, 275°C normalized HCD collision energy of 30% and an isolation width of 1.6 m/z. Monoisotopic precursor selection was set to peptide, and an intensity threshold was set to 2.5 × 10 4 .

Database search and results processing. Data were searched by SEQUEST through Proteome Discoverer 1.4 (Thermo Fisher Scientific) against a custom Mmc protein database containing 822 entries based on the CDS data available in MolliGen (42). Spectra from peptides higher than 5000 Da or lower than 350 Da were rejected. The search parameters were as follows: Mass accuracy of the monoisotopic peptide precursor and peptide fragments was set to 10 parts per million and 0.02 Da, respectively. ਸਿਰਫ ਬੀ ਅਤੇ y ions were considered for mass calculation. Oxidation of methionines (+16 Da) was considered as variable modification and carbamidomethylation of cysteines (+57 Da) was considered as fixed modification. Two missed trypsin cleavages were allowed. Peptide validation was performed using percolator algorithm, and only “high confidence” peptides were retained, corresponding to a 1% false-positive rate at the peptide level.

Label-free quantitative data analysis. Raw liquid chromatography (LC)–MS/MS data were imported in Progenesis QI for Proteomics 2.0 (Nonlinear Dynamics Ltd., Newcastle, UK). Data processing includes the following steps: (i) features detection, (ii) features alignment across the nine samples, (iii) volume integration for two to six charge-state ions, (iv) normalization on features ratio median, (v) import of sequence information, (vi) calculation of protein abundance (sum of the volume of corresponding peptides), and (vii) a statistical test (ANOVA, analysis of variance) was carried out for each group comparison and proteins were filtered based on ਪੀ < 0.05। Noticeably, only nonconflicting features and unique peptides were considered for calculation at the protein level. Quantitative data were considered for proteins quantified by a minimum of two peptides.

Animal samples

Goat sera. Normal goat sera were purchased from commercial suppliers (Sigma-Aldrich or Merck). These sera are indicated as “collected from USDA inspected facilities. All animals had received ਪਹਿਲਾਂ ਅਤੇ post mortem inspections and were found to be free of contagious diseases.”

Sera from goats infected by M. ਮਾਈਕੋਇਡਜ਼ subsp capri strain #13235 were provided by an academic research laboratory. Samples were collected before inoculation and 12 days after inoculation in previous studies (16). Upon reception, all sera were sterilized by passing through a 0.45-μm filter, aliquoted, and stored at −20°C until use.

For some assays, it was necessary to lower the albumin content of the sera, as this protein is present in very large amount and can mask or distort the signal of other proteins in SDS-PAGE or Western blot analysis. Albumin depletion was performed using the Pierce Albumin Depletion Kit (Thermo Fisher Scientific) following the manufacturer’s specific protocol for caprine serum. Briefly, 130 μl of sera was first buffer-exchanged using Zeba Spin Desalting columns (Thermo Fisher Scientific) preequilibrated in 25 mM tris (pH 7.5) and 25 mM NaCl. Subsequently, 75 μl of buffer-exchanged serum was passed through a bed of 200 μl of Cibacron Blue agarose, preequilibrated in 25 mM tris (pH 7.5) and 25 mM NaCl. The flow through was collected and is considered to be albumin-depleted.

Goat colostrum. Goat colostrum samples were collected in the 48 hours postpartum, from a herd of does raised in an academic research laboratory experimental farm. All animals were monitored during husbandry and were found to be free of diseases. Colostrum samples were pooled from six animals, aliquoted, and stored at −20°C until use.

Protein purification

Recombinant MIBs and MIPs. The plasmids encoding the recombinant MIBs and MIPs were individually transformed by heat shock in competent ਈ. ਕੋਲੀ Rosetta 2 (DE3) (Merck). Transformed bacteria were plated on LB solid media supplemented with kanamycin (50 μg/ml), chloramphenicol (34 μg/ml), and glucose (0.5% m/v) and incubated at 37°C. The colonies from one plate were scrapped in 1 ml of LB media using a cell spreader. The resulting cell suspension was used to inoculate 1 liter of Studier ZYP5052 autoinduction media, supplemented with kanamycin (100 μg/ml) and chloramphenicol (34 μg/ml), in 2-liter baffled flasks closed by a porous membrane for gas exchange. After 2 hours of incubation at 37°C, the culture was placed at 30°C for 19 to 22 hours. Cells were subsequently harvested by centrifugation (4500 rcf for 15 min), weighed, flash-frozen in liquid N2, and stored at −20°C until use. Cell lysis was performed by suspending the cell pellet in lysis buffer [50 mM tris-Cl (pH 8), 150 mM NaCl, 10 mM imidazole, and 2% (w/v) glycerol] supplemented with lysozyme (0.1 mg/ml) (Sigma-Aldrich), deoxyribonuclease I (2 μg/ml) (Sigma-Aldrich), and complete EDTA-free antiprotease (Roche). Five milliliters of buffer was used for each gram of cell pellet to lyse. The cell suspension was incubated at room temperature for 30 min and then sonicated using a Vibra-Cell 75115 VC 505 (Bioblock Scientific) for 15 cycles of 10 s on at 40 W and 59 s off while keeping the sample on ice at all time. The lysate was then clarified by centrifugation (45,000 rcf for 45 min at 4°C), and the resulting supernatant was filtered on 0.45 μm. The clarified lysate was then loaded on a 5-ml HisTrap FF column (GE), preequilibrated in lysis buffer, using an AKTA Start fast protein LC (FPLC) system (GE). After binding of the 6His-tagged recombinant proteins to the resin, an extensive washing step with 30 column volumes of lysis buffer was performed to remove unbound proteins. Bound proteins were eluted with 10 column volumes of elution buffer [50 mM tris-Cl (pH 8), 150 mM NaCl, 83.5 mM imidazole, and 2% (w/v) glycerol]. Elution fractions were collected and kept at 4°C and analyzed by SDS-PAGE to assess their purity. Appropriate fractions were pooled and concentrated on Vivaspin 30-kDa MWCO (molecular weight cut-off) ultrafiltration units (Merck), down to a volume of 2 ml. This concentrated protein solution was further polished by size exclusion chromatography using a HiPrep 16/60 Superdex 200 column (GE), preequilibrated in 20 mM Hepes (pH 7.5) and 150 mM NaCl, driven by an AKTA Purifier FPLC system (GE). The main elution peak was collected and a sample was analyzed by SDS-PAGE to assess purity. Protein concentration was determined spectrophotometrically by measuring the OD280nm (optical density at 280 nm) of the protein solution, using a Take3 Micro-Volume Plate and an Epoch plate reader (BioTek). The molar extinction coefficient of the recombinant protein was calculated using Protparam (https://web.expasy.org/protparam/). The purest and most concentrated fractions were pooled, aliquoted, and flash-frozen in liquid N2. Purified proteins were stored at −80°C until use.

Goat sIgA. Goat sIgA was purified from goat colostrum, using a protocol derived from Azwai ਅਤੇ ਬਾਕੀ. (49). First, the frozen colostrum was thawed and defatted by centrifugation (4500 rcf for 30 min at 20°C). Casein was then acid-precipitated by reducing the colostrum pH to 4, through the addition of 0.1 N HCl. After centrifugation (45,000 rcf for 30 min at 20°C), the supernatant was collected and neutralized by the addition of 2 M tris until the pH reached 8. This whey solution was then filtered on 0.45 μm and kept at 4°C.

sIgA was isolated from the whey solution using serial steps of size exclusion and affinity chromatography. First, the whey proteins were fractionated by size exclusion chromatography using a Sephacryl S300 column (GE) preequilibrated in 50 mM tris-Cl (pH 8) and 150 mM NaCl. sIgA content of the different elution fractions was analyzed by Western blot using a rabbit anti-goat sIgA primary antibody (Bethyl) and an HRP-coupled goat anti-rabbit IgG secondary antibody (Sigma-Aldrich). The sIgA-rich fractions were pooled and passed over a HiTrap Protein-G HP column (GE), preequilibrated in 20 mM phosphate buffer (pH 4), to selectively remove the contaminating goat IgG. The sIgA flowing through the protein G column was collected and polished by a second size exclusion chromatography on the Sephacryl S300 column. The main elution peak was collected and analyzed by Western blot to confirm the absence of goat IgG, using a mouse anti-goat IgG primary antibody (Jackson ImmunoResearch) and an HRP-coupled goat anti-mouse IgG secondary antibody (Sigma-Aldrich). sIgA concentration was determined spectrophotometrically by measuring the OD280nm of the protein solution, using a Take3 Micro-Volume Plate and an Epoch plate reader (BioTek). The molar extinction coefficient used for this protein is identical to the one used in Kanamaru ਅਤੇ ਬਾਕੀ. (50) for bovine sIgA. The purified protein was aliquoted, flash-frozen in liquid N2, and stored at −80°C until use.

Cryo–electron microscopy

Sample preparation. For the MIB83-Fab- S759A MIP82 complex, freshly purified MIB83 and S759A MIP82 and commercial goat IgG Fab fragment (Jackson ImmunoResearch) were used for cryo-EM sample preparation. Proteins were mixed and incubated at 4°C for 4 hours at final concentrations of 1 mg/ml each. The mixture was loaded on a Superdex 200 Increase 10/300 (GE Healthcare) size exclusion chromatography column and eluted with 20 mM Hepes and 150 mM NaCl (pH 7.5). Fractions containing the complex were collected and applied to C-Flat R2/1-2Cu-50 grids (QUANTIFOIL), previously glow-discharged for 45 s at 2 mA (ELMO Cordouan). The sample was vitrified with a Vitrobot Mark IV (Thermo Fisher Scientific) at 4°C at 100% humidity. Four microliters of sample was applied onto the glow-discharged grids. The excess of sample was immediately blotted away with 4-s blot time and 0 blot force with Whatman paper (⌀ 55/20 mm) and the grid was plunged into liquid ethane. For the MIB83-Fab complex, MIB83 and Fab fragment were mixed and incubated at room temperature for 20 min at final concentrations of 1 mg/ml each. The complex was isolated by gel filtration using the same column and buffer as above. QUANTIFOIL R2/2-Cu-200 grids were glow-discharged for 30 s at 2 mA. Four microliters of sample was vitrified under similar conditions to previous ones with 2-s blot time and 0 blot force.

Data acquisition. For the MIB83-Fab- S759A MIP82 complex, movies were recorded on Titan Krios (Thermo Fisher Scientific) operated at 300 kV equipped with Gatan K2 Summit direct electron-counting camera at ×165,000 magnification and a pixel size of 0.83 Å per pixel using SerialEM (51). Micrographs were collected in a defocus range of −0.7 to −2.7 μm and with a dose of 1.45 electrons per Å 2 per frame.

For the MIB83-Fab complex, movies were recorded on Talos Arctica (Thermo Fisher Scientific) operated at 200 kV equipped with a Gatan K2 Summit direct electron-counting camera at ×36,000 magnification and a pixel size of 1.13 Å per pixel using SerialEM (51). Micrographs were collected in a defocus range of −0.5 to −2.1 μm and with a dose of 0.78 electrons per Å 2 per frame.

Image processing. For the MIB83-Fab- S759A MIP82 complex, movies were aligned for beam-induced motion using MotionCor2 (52) and CTF (contrast transfer function) parameters were assessed using the computer program GCTF. The following steps were performed using RELION (v3.0.7) (53). Details and statistics about each dataset are provided in table S1. MIB83-Fab- S759A MIP82 complexes were manually picked and particles were extracted using a box size of 256 pixels, and then these particles were 2D classified. The 2D classes corresponding to distinct orientations of the complex were selected and used as references to automatically pick particles in all the micrographs. After extraction, 2,587,740 particles were processed using cryoSPARC (v2.13.2) (54) and several rounds of 2D classification were performed. Using 925,964 particles, an initial 3D map was reconstructed without imposing symmetry. This initial map was refined using nonuniform refinement. This refined 3D map and the particles were further processed in RELION to perform 3D classification. One class with 255,991 particles was selected, a Bayesian polishing was applied on this particle dataset, and a final 3D refinement was performed. The final resolution was calculated with two masked half-maps, using 0.143 Fourier shell correlation (FSC) cutoff criterion. Local resolution was estimated using RELION (53) (fig. S2).

For the MIB83-Fab fragment complex, movies were aligned using full-frame motion correction on cryoSPARC (v2.13.2) (54) and CTF parameters were assessed using CTFFIND4 (55). The particles were automatically picked using blob picker and 6,980,198 particles were extracted using a box size of 160 pixels. Several rounds of 2D classification were performed and 3,517,059 were saved. A smaller subset of 635,925 particles was used for an initial 3D map, which was reconstructed without imposing symmetry. The 3,517,059 particles and the initial 3D map were used to perform a nonuniform refinement. The final resolution was calculated with two-masked half-maps, using a 0.143 FSC cutoff criterion. Local resolution was estimated using cryoSPARC (fig. S7).

Model building and refinement of atomic models. For the model of MIB83 in the MIB83-Fab- S759A MIP82 complex, a homology model of Protein M TD [Protein Data Bank (PDB): 4NZR] was fitted in the refined cryo-EM map. Using this model as starting point, an initial 3D model of MIB83 was manually built in Coot (v0.8.9.2) (56). The map was sharpened in PHENIX (v1.16-3546-000) (57). The final model was refined by several rounds of manual refinement in Coot software and real-space refinement using phenix.real_spacerefine with secondary structure restraints. The model was validated using MolProbity (58) and phenix.validation_cryoem implemented in PHENIX software.

For the model of S759A MIP82, similar processes were performed using protease domains as starting point. The densities corresponding to the N-terminal domain (residues 41 to 157) of MIP were poorly resolved. A homology model of this domain was generated using the available crystal structure of this domain from Ureaplasma parvum as a template (PDB: 3JVC). Rigid-body docking followed by molecular dynamics flexible fitting [using MDFF (59) in VMD molecular visualization software (60) using 200 minimization steps and 50,000 time steps] was performed to place this domain in the corresponding densities.

A homology model for a goat Fab was generated in SWISS-MODEL (61) using a consensus sequence for the light and heavy chains. Rigid-body docking followed by molecular dynamics flexible fitting (using MDFF in VMD using 200 minimization steps and 50,000 time steps) was performed to fit the Fab model into the corresponding densities.

For the model of MIB83 in the MIB83-Fab complex, the previous refined MIB83 model was fitted in the refined cryo-EM map. The map was sharpened in PHENIX. Several rounds of manual refinement in Coot software were used to refine the final model and real-space refinement using phenix.real_spacerefine with noncrystallographic symmetry restraints. The model was validated using MolProbity and phenix.validation_cryoem implemented in PHENIX software.

Immunoglobulin cleavage assay

In vitro cleavage. Purified IgG from goat serum (Sigma-Aldrich), IgM from goat serum (Rockland), IgG anti-HRP from goat (Jackson ImmunoResearch), IgG anti-hAlbumin from goat (Bethyl), IgG anti-hTransferrin from goat (Bethyl), and IgG anti-HA tag (Bethyl) were purchased from commercial vendors. Goat sIgA and recombinant MIBs and MIPs were prepared in-house (see above). Antibody cleavage assays were performed by mixing the purified proteins at final concentrations of 4 μM MIB, 4 μM MIP, 2 μM IgG, 1 μM sIgA, and 0.4 μM IgM. These concentrations correspond to the following molar ratios: IgG:MIB:MIP, 1:2:2 sIgA:MIB:MIP, 1:4:4 and IgM:MIB:MIP, 1:10:10. These ratios correspond to one MIB and one MIP molecule per Fab fragment. The reactions were assembled in a final volume of 15 μl of PBS. The immunoglobulins were systematically added first, followed by the MIBs and lastly the MIPs. The reactions were incubated at room temperature for 10 min, before addition of 5 μl of 4× Laemmli buffer containing β-mercaptoethanol and denaturation at 95°C for 10 min. Samples were subsequently separated by SDS-PAGE on a 10% acrylamide gel and stained using colloidal Coomassie staining to assess immunoglobulins integrity. Alternatively, Western blot was used to specifically detect the immunoglobulin chains in the samples. Goat IgG was detected using a mouse anti-goat IgG primary antibody (Jackson ImmunoResearch) and an HRP-coupled goat anti-mouse IgG secondary antibody (Sigma-Aldrich). Goat IgM was detected using a rabbit anti-goat IgM primary antibody (Sigma-Aldrich) and an HRP-coupled goat anti-rabbit IgG secondary antibody. Goat sIgA was detected as described above.

Antigen-bound immunoglobulin cleavage. HRP isolated from horseradish roots (Sigma-Aldrich), human albumin (Jackson ImmunoResearch), and human transferrin (Jackson ImmunoResearch) were purchased from commercial vendors. Immunoglobulin cleavage assays were performed by mixing the purified proteins at final concentrations of 2 μM IgG, 10 μM antigen, 5 μM MIB, and 5 μM MIP, in a final volume of 15 μl of PBS. The antibody and the antigen were incubated for 20 min at room temperature before sequential addition of MIB and MIP. The reaction was further incubated for 10 min at room temperature before addition of 5 μl of 4× Laemmli buffer containing β-mercaptoethanol and denaturation at 95°C for 10 min. Samples were subsequently separated by SDS-PAGE on a 10% acrylamide gel and stained using colloidal Coomassie staining to assess immunoglobulin integrity. Alternatively, Western blot was used to specifically detect the immunoglobulin chains in the samples, as described above.

A similar cleavage assay was performed by mixing the purified proteins at final concentrations of 3 μM IgG anti-antigen, 10 μM antigen, 6 μM MIB, and 6 μM MIP, in a final volume of 200 μl of PBS. After incubation of the protein mixture, the samples were analyzed by size exclusion chromatography using a Superdex 200 column (GE), preequilibrated in PBS, and driven by an AKTA Purifier FPLC system (GE). Elution fractions of 0.5 ml were collected and subsequently concentrated twofold using a Savant SpeedVac concentrator (Thermo Fisher Scientific) at room temperature. To 15 μl of the concentrated fractions, 5 μl of 4× Laemmli buffer containing β-mercaptoethanol was added. Samples were denatured at 95°C for 10 min and subsequently separated by SDS-PAGE on a 10% acrylamide gel and stained using colloidal Coomassie.

In cellulo immunoglobulin cleavage. Mmc cells were first inoculated in SP5 media from frozen stock and grown overnight. Approximately 1 × 10 9 cells from cultures in late exponential phase (pH

6.8) were collected by centrifugation at 6800 rcf for 10 min. The pellet was washed by resuspending the cells in 500 μl of fresh SP5 media without fetal bovine serum (SP5ΔFBS) and then harvested again by centrifugation at 6800 rcf for 10 min. The pellet was then resuspended in 15 μl of SP5ΔFBS containing either purified immunoglobulin (100 ng/μl) or 2% (v/v) of albumin-depleted goat serum. After 30 min of incubation at 37°C, the cells were pelleted by centrifugation at 6800 rcf for 10 min. The supernatant was collected and mixed with 5 μl of 4× Laemmli buffer containing β-mercaptoethanol and denatured at 95°C for 10 min. Immunoglobulin integrity was checked by Western blot using the protocols described above.

Agglutination assays

Mmc cells were first inoculated in SP5 media from frozen stock and grown overnight. The next day, the cultures in late exponential phase (pH

6.8) were used to inoculate fresh SP5ΔSerum containing 4% goat serum (v/v). One-milliliter cultures were performed in 1.5-ml tubes, while 200-μl cultures were performed in flat-bottomed 96-well Costar cell culture plates (Corning). Cultures were incubated overnight at 37°C without agitation. Agglutination in tubes was assessed by placing the tubes in a hollowed rack and letting them stand undisturbed for 30 min before imaging with a Samsung Galaxy S8 SM-G950. Agglutination in microplates was assessed by observing and imaging individual wells with either a Nikon SMZ1270 stereomicroscope coupled to a Nikon DS-Fi2 camera and a Nikon DS-U3 controller, or a Nikon Eclipse TS100 inverted microscope coupled to a DS-Fi2 camera and a DS-L3 standalone camera controller. To image the aggregate, the tubes were mixed by inversion and the culture was collected using a wide-bore pipette tip. Samples were mounted between a glass slide and a coverslip and imaged using a Nikon Eclipse Ti microscope equipped with a Nikon C-DO dark field condenser coupled to a Nikon DS-Qi1Mc camera and a Nikon DS-U3 controller.

To quantify the agglutination, the microplate wells were emptied by gentle pipetting to not disturb the settled aggregates. Optical density in each well was measured at 310 nm using an Epoch 3 spectrophotometer.